Родился 3 июня 1941 года, станция Погрузная Кошкинского района Куйбышевской области.
В 1969 году окончил Ульяновский сельскохозяйственный институт по специальности механизация сельского хозяйства. В настоящее время кандидат технических наук, профессор. Академик Международной академии аграрного образования (г. Москва). Имеет научные публикации, изданные книги, авторские свидетельства на изобретения и патенты.
Трудовую деятельность начал с 1961 года, работал шофёром. После службы в рядах Советской Армии учился и преподавал в сельскохозяйственном институте. С 1969 года по 2001 год последовательно прошёл ступени: ассистента, аспиранта (по совместительству старшего научного сотрудника), старшего преподавателя, доцента, заведующего кафедрой, декана факультета механизации сельского хозяйства, проректора по учебной работе. В 1995 году был избран ректором Ульяновской государственной сельскохозяйственной академии. Имеет государственные награды: орден Почёта (2009), медаль «За доблестный труд в ознаменовании 100-летия со дня рождения В. И. Ленина», медаль «За трудовую доблесть» (1981).
Борис Иванович Зотов женат, двое сыновей.
В свободное время читает историческую и мемуарную литературу, активный отдых связан с пребыванием на природе, среди видов спорта предпочитает плавание.