5-й Председатель Русского Исторического Общества (бывшее Императорское Русское Историческое Общество) в 1932-1933 гг.
Прадед Кизеветтера был кузнецом и происходил из Тюрингии, дед-музыкант — переселился в Россию. Отец окончил юридический факультет Петербургского университета, заведовал архивом главного штаба; мать — А. Н. Турчанинова, была внучкой протоиерея и церковного композитора, дочерью воспитанника Духовной академии и преподавателя истории.
Образование получил на историко-филологическом факультете Московского университета. В 1903 защитил диссертацию на степень магистра русской истории: «Посадская община в России XVIII столетия». Напечатал ряд статей по русской истории в журналах («Русская мысль», «Русское богатство», «Образование», «Журнал для всех», «Журнал Министерства народного просвещения»), а также ряд научно-популярных очерков, изданных отдельными брошюрами книгоиздательством «Донская Речь». Читал лекции в Московском университете и на Московских «коллективных уроках» и Женских курсах.
Видный деятель партии кадетов. В 1904 вступил в «Союз освобождения», был избран членом ЦК партии кадетов (1906). Депутат 2-й Государственной думы.
С февраля 1919 года заведующий отделением Государственного архивного фонда, затем профессор 2-го МГУ и заведующий центральным архивом ВСНХ.
По постановлению Коллегии ГПУ от 25 августа 1922 года выслан за границу. Первоначально выехал в Берлин. В январе 1923 года прибыл в Прагу, где провёл оставшуюся жизнь.
Был профессором русской истории в Пражском университете. Член Союза русских академических организаций за границей, товарищ председателя, с 1932 года — председатель Русского Исторического Общества.
Похоронен в Праге на Ольшанском кладбище.
Реабилитирован в 1993 году.