Из лифляндских дворян. Воспитывался в частном пансионе. В декабре 1790 г. после смерти отца переехал к родным в Петербург и был определён капралом в 5-й флотский батальон в Кронштадте. Летом 1793 г. за предотвращение попытки заключенных освободиться от конвоя и проявленные при этом присутствие духа и распорядительность был переведён с чином подпрапорщика в гатчинский батальон Великого Князя Александра Павловича.
Получив 29 сентября 1796 звание подпоручика, в ноябре того же года был переведён в л.-гв. Семёновский полк. Став полковником, 7 марта 1805 был назначен в 1-й Морской полк, 15 января 1807 назначен его командиром, через три года – шефом 2-го Морского полка.
В начале 1812 г. полк состоял в 1-й бригаде 25-й пехотной дивизии и находился в Финляндии. На него было возложено обучение дружин Петербургского ополчения. В начале октября отряд, состоявший из 2-го Морского полка и пяти ополченческих дружин, прибыл в Новгород, где Пейкер продолжал обучение Новгородского ополчения. Примерно через месяц он выступил с отрядом П.М.Волконского на Торопец для прикрытия Московской дороги, но вскоре был направлен на усиление 1-го отдельного корпуса, к которому и прибыл в декабре.
В 1813 г. Пейкер с полком участвовал в блокаде Пиллау и Данцига. Здесь, в ночь на 19 мая, он, командуя центральным отрядом, выбил неприятеля из передового укрепления Штольценбергского предместья и срыл его. В августе осажденные многократно пытались прорвать блокаду Данцига на участке отряда Пейкера, но каждый раз получали отпор. За отличие в кампании 1813 г. Пейкер был произведен 15 сентября в генерал-майоры. Оставался в Данциге до марта 1814 г. и после окончания военных действий возвратился в Россию.
В 1819 г. ему был пожалован орден Св.Анны 1-й ст.; 6 июня 1821 награждён орденом Св.Георгия 4-го кл. № 3484
11 мая 1824 был назначен начальником 1-й пехотной дивизии и 22 августа 1826 получил чин генерал-лейтенанта. Ухудшившееся здоровье вынудило его просить более спокойной должности, и 11 февраля 1828 он был назначен комендантом Нарвы, где и служил до кончины.