Учился в университете Галле, но узнав о философии Канта, добился (1788) перевода в Кёнигсберг. Около года слушал лекции Канта и был к нему очень близок, признаваясь в письмах, что нашёл в великом философе второго отца. В октябре 1789 г. оставил Кёнигсберг и переехал в Берлин, где его ждала должность учителя трёх младших детей короля Фридриха Вильгельма II. Пути Кизеветтера разошлись с Кантом после того, как в 1791 г. вышла книга Кизеветтера «Основы чистой общей логики, изложенной с кантианских позиций» (нем. Grundri? einer reinen allgemeinen Logik, nach Kantischen Grunds?tzen), которую Кант расценил как плагиат; этот учебник был затем переведён на русский язык и широко использовался: со ссылкой на него приводит Л. Н. Толстой в «Смерти Ивана Ильича» пример силлогизма — «Кай — человек, люди — смертны, поэтому Кай смертен». В дальнейшем Кизеветтер был профессором логики в Военной академии.
Наиболее фундаментальным сочинением Кизеветтера осталось «Versuch einer fa?lichen Darstellung der wichtigsten Wahrheiten der neuern Philosophie, f?r Uneingeweihte» (1795—1803).