Родился в Египте в бедной семье. Получил образование в основном из чтения Священного Писания. Жизнь проводил в Скитской пустыни в Нижнем Египте где поселился около 431 года.
В начале своего монашеского пути Исаия пользовался наставления преподобного Пимена Великого и включил ряд его изречений в свои сочинения.
На закате жизни подвизался в полном отшельничестве, за что и получил свое прозвание.
Исаия Отшельник сочетал отшельничество с плодотворной церковно-литературной деятельностью. Характер сочинений аскетический. Язык оригинала египетский. Значительная часть сочинений утрачена. Собрание известных произведений включают в себя: