Жан-Александр-Генрих Клапье де-Колонг родился 22 февраля (2 марта) 1839 в Динабурге в дворянской семье.
Учился в Морской академии у и с 1870 работал в ней преподавателем.
С 1878 руководил компасным делом флота. С 1898 — номинальный начальник Главного гидрографического управления. Работавший одно время под началом Ивана Петровича А.Н. Крылов, очень тепло отзывался о де-Колонге в своих воспоминаниях. Иван Петрович де-Колонг — создатель теории девиации магнитного компаса. В 1875 году он сконструировал дефлектор — прибор для измерения и устранения девиации, а позже усовершенствовал свое изобретение.
За работы по девиации магнитного компаса И.П. де-Колонг был награжден Ломоносовской премией Академии Наук.