Род Вахромеевых (до революции Вахрамеевы) — купеческий род Ярославля.
Прадед — Иван Александрович — основал в 1909 городскую биржу, первым председателем которой стал его родственник Николай Николаевич Вахрамеев. Дед — Александр Иванович — был городским головой.
К 300-летию Дома Романовых, в 1913, купцам Вахромеевым было пожаловано дворянство, после чего они переехали в Москву.
Родитель — Варфоломей Александрович (1904—1984) — преподаватель Гнесинского музыкального училища при Московской консерватории, давал частные уроки. В числе его учеников были дети из семей советской номенклатуры. К своему 80-летию, за составление Учебника церковного пения для Духовных школ, Варфоломей Александрович был награждён орденом св. равноап. кн. Владимира II степени.
Родительница — Александра Фёдоровна (1903—1981), а также старшая сестра Ольга Варфоломеевна Вахромеева (1925—1997) тоже были педагогами московских музыкальных школ.
В 1953 году окончил среднюю школу и параллельно хоровое отделение детской музыкальной школы, директором которой был его родитель.
1953—1957 — воспитанник Московской духовной семинарии (Загорск).
В 1954—1961 годы нёс послушание иподиакона у митрополита Крутицкого Николая (Ярушевича), параллельно с иподиаконством у Патриарха Алексия I.
В 1957—1961 годы обучался в Московской духовной академии.
3 апреля 1959 года пострижен в монашество с именем Филарет (в честь праведного Филарета Милостивого) наместником Троице-Сергиевой Лавры архимандритом Пименом (Хмелевским) (впоследствии архиепископ Саратовский).
26 апреля 1959 года за литургией в Богоявленском Патриаршем соборе в Москве был рукоположён во иеродиакона Патриархом Алексием.
1961 год — после окончания Московской духовной академии со степенью кандидата богословия, оставлен при Академии в качестве профессорского стипендиата с поручением чтения лекций по истории и разбору западных исповеданий на III курсе Академии, а позже ему было поручено преподавание гомилетики в Академии и Семинарии.
14 декабря 1961 года за литургией в освящённой в честь праведного Филарета Милостивого крестовой церкви в Патриарших покоях Троице-Сергиевой Лавры Патриархом Алексием был рукоположён во иеромонаха.
С сентября 1962 года — старший помощник инспектора Московской духовной академии.
С июня 1963 года — инспектор Московской духовной академии .
4 августа 1963 года в Успенском соборе Троице-Сергиевой Лавры, по благословению Патриарха Алексия, епископом Волоколамским Питиримом (Нечаевым) был возведён в сан игумена с возложением палицы и креста с украшениями.
С сентября 1963 года — заведующий аспирантурой Московской духовной академии.
С 8 октября 1963 года — архимандрит.
С 17 октября 1963 года — секретарь Комиссии Священного синода по вопросам христианского единства.
С 1 октября 1964 года — доцент.
8 октября 1965 года состоялось решение Патриарха Алексия и Священного Синода о его бытии епископом Тихвинским, викарием Ленинградской епархии.
24 октября 1965 года в Троицком соборе Александро-Невской Лавры был хиротонисан во епископа; хиротонию совершали: митрополит Ленинградский и Ладожский Никодим (Ротов), архиепископы Пермский и Соликамский Леонид (Поляков), Херсонский и Одесский Сергий (Петров), Минский и Белорусский Антоний (Мельников), епископы Дмитровский Филарет (Денисенко), Кировский и Слободской Иоанн (Иванов), Вологодский и Великоустюжский Мелхиседек (Лебедев).
14 мая 1966 года — 18 апреля 1973 года — епископ Дмитровский, викарий Московской епархии и ректор Московской духовной академии.
28 ноября 1968 года — 19 октября 1971 года — второй заместитель председателя Отдела внешних церковных сношений Московского патриархата.
С 20 марта 1969 года — член Комиссии Священного Синода РПЦ по вопросам христианского единства.
С 6 января 1971 года до 25 августа 1972 года временно управлял Калининской епархией.
С 9 сентября 1971 года — архиепископ.
18 апреля 1973 год — 10 октября 1978 года — архиепископ Берлинский и Среднеевропейский, Патриарший Экзарх Средней Европы.
С 15 апреля 1975 года — митрополит.
С 10 октября 1978 года — митрополит Минский и Белорусский.
С 12 октября 1978 года по 28 марта 1984 года — Патриарший Экзарх Западной Европы.
16 ноября 1979 года — 28 марта 1984 года — Временно управлял Корсунской епархией.
14 апреля 1981 года — 13 ноября 1989 года — Председатель Отдела внешних церковных сношений Московского патриархата.
С 14 апреля 1981 года, как Председатель Отдела внешних церковных сношений, — постоянный член Священного Синода Русской Церкви.
С 22 июля 1981 года — заместитель председателя (по должности) постоянного Рабочего президиума по подготовке и проведению юбилея 1000-летия Крещения Руси и глава Рабочей группы по участию в праздновании других Церквей и по общественным проблемам.
С 26 августа 1981 года — член Центрального Комитета Всемирного Совета Церквей.
С 1985 года — правящий архиерей Воскресенского прихода РПЦ в г. Рабате (Марокко) по должности Председателя ОВЦС.
С 26 июня 1985 года — поручено архипастырское окормление Патриарших приходов в Финляндии.
С 10 сентября 1987 года — поручено архипастырское окормление Свято-Покровской общины в Сиднее (Австралия) по должности Председателя ОВЦС.
С 16 октября 1989 года — митрополит Минский и Гродненский, Патриарший Экзарх всея Белоруссии.
С января 1990 года — председатель Синода Белорусской Православной Церкви.
С 8 мая 1990 года — член Синодальной Библейской Комиссии МП.
С 19 июля 1990 года — председатель Комиссии Священного Синода РПЦ по содействию усилиям в преодолении последствий аварии на Чернобыльской АЭС.
С 18 февраля 1992 год — Митрополит Минский и Слуцкий, Патриарший Экзарх всея Белоруссии, Свято-Успенской Жировичской обители священноархимандрит.
С 28 декабря 1993 года — председатель Синодальной Богословской Комиссии Священного Синода (бывшая Комиссия по вопросам Христианского единства).
С 3 февраля 1994 года — священноархимандрит Свято-Благовещенского Ляданского мужского монастыря (Минская епархия).
25 января 2009 года — Архиерейским Собором РПЦ в Москве избран одним из трёх кандидатов на Московский патриарший престол.
27 января 2009 года — в ходе заседания Поместного Собора, во вторник, во второй половине дня Филарет взял самоотвод, призвав своих сторонников отдать голоса местоблюстителю патриаршего престола, митрополиту Смоленскому и Калининградскому Кириллу, ставшего впоследствии Патриархом.
19 декабря 1983 года — избран Председателем Общественной комиссии Советского комитета защиты мира по связям с религиозными кругами, выступающими за мир.
С 11 октября 1984 года —вице-президент Общества «СССР—Австрия» и заместитель председателя Центрального правления Общества.
С 23 января 1985 года — член Советского комитета защиты мира.
С 4 июня 1985 года — вице-президент Общества «СССР—Кипр» и член Центрального правления Общества.
С 5 июня 1985 года — член Советского комитета за европейскую безопасность и сотрудничество.
С 30 ноября 1987 года — вице-президент Общества «СССР—Греция» и членом Центрального правления Общества.
15 декабря 1988 года избран бюро президиума Советского комитета защиты мира и правлением Ассоциации содействия ООН в СССР в состав избирательной комиссии по выборам народных депутатов СССР от движения за мир, объединяемого СКЗМ, и Ассоциации содействия ООН в СССР.
С 28 декабря 1988 года — вице-президент Международной ассоциации творческой интеллигенции «Мир культуры».
С 8 февраля 1990 года — член Совета Белорусского отделения Международного Фонда славянской письменности и славянских культур.
С 17 марта 1990 года по 1995 год — народный депутат Верховного Совета Белоруссии.
С 25 июля 1990 года — председатель Комиссии Верховного Совета БССР по вопросам депутатской этики.
С 14 февраля 1991 года — Народный депутат СССР.
27 марта 2009 года на встрече Президента Республики Беларусь Александра Лукашенко с членами Синода БПЦ заявил: «В связи с исключительной важностью данной проблемы мы призываем ввести действенное регулирование интернет-содержимого на законодательном уровне.»