Дед — Василий Христианович Адамс (1827—1908) — генерал-майор, военный инженер. Отец — Василий Васильевич Якобс, родился в 1874, окончил Николаевское кавалерийское училище, полковник белой Северо-Западной армии (1919), эмигрировал в Эстонию. После присоединения Эстонии к СССР был арестован, расстрелян в Москве в 1940 или 1941. Мать — Татьяна Леонидовна, урождённая Епинатьева (1904—1996), дочь потомственного почётного гражданина Ревеля.
Жена — Татьяна Петровна, урождённая Соловьёва (1919—1974). Дочери — Елена и Мария.
Вячеслав Якобс окончил 6 среднюю школу (1943), ныне именуемая Таллинской Центральной Русской Гимназией, а также Ленинградскую духовную семинарию (1951; заочно).
С 1943 служил псаломщиком в церкви Рождества Богородицы в Таллине. С 19 августа 1945 — диакон, с 8 февраля 1948 — иерей, настоятель храма Марии Магдалины в Хаапсалу. Одновременно служил и на других приходах Таллинской епархии. Одним из его духовников был протоиерей Михаил Ридигер, отец Патриарха Алексия II.
В 1951—1957 служил в храме в городе Вологде.
27 февраля 1957 был арестован управлением КГБ по Вологодской области по обвинению в антисоветской агитации (обвинение основывалось на хранении священником православной литературы и его беседах с верующими на религиозные темы). В мае 1957 приговорён Вологодским областным судом к 10 годам лишения свободы, заключение отбывал в Дубравлаге (Мордовия). Сохранились и опубликованы письма, которые посылал в лагерь священнику Вячеславу Якобсу таллинский протоиерей Валерий Поведский.
В июне 1960 срок заключения ему был снижен до пяти лет, и 12 сентября 1960 г. священник Вячеслав Якобс был условно-досрочно освобождён. Реабилитирован 14 октября 1988.
С ноября 1960 — настоятель храма Иоанна Предтечи в Нымме (Таллин). Был возведён в сан протоиерея, награждён митрой. Избирался председателем приходского совета.
Последовательный сторонник сохранения Эстонской православной церкви в юрисдикции Московского Патриархата. В 1993 самостоятельный характер этой церкви в составе Московского Патриархата был подтверждён Патриархом Алексием II (первоначально соответствующее решение было принято ещё Патриархом Тихоном в 1920). Однако в течение длительного времени статус церкви в современной Эстонии носил неопределённый характер (так как значительная часть эстонских политиков поддерживали конкурирующую структуру — Эстонскую апостольскую православную церковь Константинопольского Патриархата), и лишь в 2001 её устав был официально зарегистрирован эстонскими властями.
Почётный гражданин Таллина. Награждён Республиканской премией по культуре имени Игоря Северянина 2001 года.
Церковные:
Светские награды: