В 1914 году окончил Строгановское художественно-промышленное училище в Москве, затем преподавал в нём до 1918 года. С 1919 года работал в Пермской губернии. Организовал художественно-производственные мастерские в Перми, Кудымкаре и Кунгуре, которые стали базой художественного образования в Прикамье. Был первым директором Пермского художественного техникума. Основал Коми-пермяцкий окружной краеведческий музей, который теперь носит его имя.
В своих произведениях Субботин-Пермяк связал традиции коми-пермяцкого народного искусства с достижениями художественного авангарда начала XX века. Его работы хранятся в Коми-пермяцком окружном краеведческом музее и Пермской государственной художественной галерее.
Субботин-Пермяк похоронен в Перми на Егошихинском кладбище. В 2001 году на его могиле был открыт новый памятник.
Воронежская баба. 1912.
Вниз по реке. 1918.
Рабочий. 1921.
Натюрморт с булками и посудой. 1921.