Принц Виктор родился в 1862 году, его родителями были Наполеон Жозеф Бонапарт и Клотильда Савойская. По велению Наполеона Эжена в возрасте восемнадцати лет принц стал главой дома Бонапартов. Таким образом в 1879 году он стал Наполеоном V, хотя многие бонапартисты отдавали предпочтение его младшему брату принцу Луи. В 1884 году произошёл резкий разрыв отношений между отцом и сыном, и вместе с тем бонапартистская партия распалась на сторонников Жерома Наполеона и Виктора Наполеона. В мае 1886 года князья бывшей правящей династии были изгнаны из Французской республики и принц Виктор уехал в Бельгию. Смерть отца в 1891 году поставила его во главе всей бонапартистской партии, но сама партия эта потеряла к тому времени всякое значение. Принц Виктор умер в 1926 году в Брюсселе.
Его женой была Клементина Бельгийская, у них было двое детей: Мария Клотильда Бонапарт, принцесса Наполеон (1912—1996) и Луи Бонапарт, принц Наполеон (1914—1997).