Родился 15 июня 1963 в селе Завидово Мукачевского района Закарпатской области. Окончил Львовский торгово-экономический институт в 1984.
В сентябре 2006 года был назначен руководителем Секретариата президента (СП) Украины. Возглавив СП, Балога изменил его структуру и ввёл жёсткую вертикаль власти, замкнув все информационные потоки на себя и на своего первого заместителя Арсения Яценюка, представителя президента в Кабинете министров. Ему прямо или опосредованно были подчинены все ключевые службы СП. Одним из пунктов указа президента, утвердившего новую структуру СП, стала ликвидация региональных приёмных президента, созданных летом 2005 года во всех областных центрах, а также в Симферополе, Севастополе и Киеве.
В феврале 2008 года Виктор Балога заявил о выходе из состава «Нашей Украины» и поддержал создание новой политической партии «Единый центр».
В мае 2009 года Виктор Балога подал в отставку с должности Главы Секретариата Президента. 19 мая 2009 года отставка была принята президентом Ющенко. На вопрос журналистов о том, почему он не сработался с супругой президента Катериной Чумаченко и секретарём СНБО Раисой Богатырёвой, Балога двусмысленно ответил, что у него «молодая и красивая жена». Виктор Балога обвинил президента Ющенко в коррупции, кумовстве, неэффективности, некомпетентности и двойных стандартах при принятии политических решений и заявил, что действовал против премьер-министра Тимошенко не по своей воле.
Виктора Балогу самого обвиняли в коррупции фракция Коммунистической партии Украины, премьер-министр Юлия Тимошенко, руководитель фракции БЮТ в парламенте Николай Томенко.
Виктор Балога оказывает определённую поддержку русинскому национальному движению; в частности он выступает за официальное признание на Украине русинов как отдельной национальности.
Виктор Балога женат, у него двое сыновей и дочь. Брат Иван — глава областной рады (с 23/11/2010 года) и председатель партии «Единый центр» (с лета 2008 года) в Закарпатской области. Другой брат — Павел, предприниматель.