В 1972 году окончил Ленинградскую консерваторию им. Н. А. Римского-Корсакова по классу С. М. Слонимского. С 1973 по 1977 год преподавал в Ленинградской консерватории, затем до 1982 года в музыкальном училище при консерватории. В дальнейшем преподаватель класса композиции Санкт-Петербургской детской школы искусств им. Е. А. Мравинского.
Член жюри Всероссийского конкурса композиторов имени А. П. Петрова, а также детских музыкальных конкурсов «Юные дарования» и «Музыка — моя душа», председатель жюри композиторского конкурса «Хоровая лаборатория». Является также художественным руководителем международного фестиваля «Земля детей».
Заслуженный работник культуры Российской Федерации (2007). Лауреат премии правительства Санкт-Петербурга «За гуманизацию школы Санкт-Петербурга» (2004).
Владимир Сапожников пишет практически во всех музыкальных жанрах. Он автор шести симфоний, балетов, оперы, ораторий, кантат, инструментальных концертов, различных камерных сочинений. Значительную часть творчества составляют сочинения для хора, особое внимание уделяет музыке, адресованной детям.
Среди сочинений: