Родился 8 сентября 1945 года в Харькове (на Украине) в семье фармацевтов. Отец Пётр Григорьевич Фокин (1913—2000), мать Циля Израилевна Жарницкая (1916—1991).
Выпускник электромашиностроительного факультета Харьковского политехнического института (1967), где два года оставался на кафедре инженером. В 1969—71 служил в войсках ПВО (командир взвода). В дальнейшем (1971—73) преподавал математику и электротехнические дисциплины в Донецком политехникуме.
Одновременно в 1964—70 гг. руководил студенческим самодеятельным театром «Силуэт», что подвигло его поступить во ВГИК, режиссёрский факультет которого окончил в 1978 году (мастерская Ю. Егорова). Дебютом и выпускной работой был короткометражный фильм «Смерть чиновника» (1978), хотя уже в 1977 году Владимир Фокин принял участие в съёмках фильма «Ливень».
В 1980-е активно снимал фильмы. Наибольшую известность ему принёс телесериал «ТАСС уполномочен заявить...» (1984).
В 1990-е снимал меньше. В первой половине был художественным руководителем киностудии «РАПИД» (1990—1995), затем годах работал главным режиссером телекомпании «Каскад» (1996—1997). В эти же годы Владимир Фокин активно работал и на телевидении (циклы передач «Клуб земляков» (1993—1994) и «Старая квартира» (1998—1999), документальный телефильм «Последний миф» (1994)), а также преподавал во ВГИКе.
В июле 2010 году руководил второй Международной летней киношколой ВГИКа, проходящей в Азове.
Супруга — Людмила Аркадьевна Сибилева — преподаватель по классу фортепиано. Дочь Полина (род. 1972) — актриса.