Племянник Антуана, Бернара и Жозефа де Жюссьё, отец Адриена Анри Лорана де Жюссьё.
Став профессором ботаники в Королевском ботаническом саду, стал развивать теорию классификации растений своего дяди, Бернара Жюссьё, обращая внимание на характерные особенности растений.
Система классификации растений была представлена Антуаном в Академию наук в 1773—1777 годах, издана под заглавием «Genera plantarum secundum ordines naturales disposita, juxta methodum in Horto Regio Parisiensi exaratum, anno 1774» (Париж, 1789, in 8° (лат.)) и составляет целую эру в истории ботаники. Растения с системе Антуана Жюссьё расположены в виде восходящей лестницы, начиная с водорослей и грибов и кончая цветковыми растениями.
Член Французской академии наук с 1782 года.
С 1789 по 1824 годы Антуан де Жюссьё старался усовершенствовать свою систему целой серией дополнений; он считал, что семейства можно описывать как виды и что следует обращать внимание на характерные черты органов растений, подчиняя одни другим, смотря по группе рассматриваемых растений. Идея подчинения групп отличает систему Жюссьё от систем его современников и предшественников. Система его, однако, была принята далеко не всеми. Считал биологические виды неизменными.
В 1794 году был назначен директором нового Национального музея ествествознания.
Жюссьё было издано множество работ, касающихся различных семейств растений, а также важный труд под названием «Principe de la m?thode naturelle des v?getaux» (Париж, 1824).