Наиболее известный его труд, The Later Roman Empire, 284—602 (1964) («Поздняя Римская империи») рассматривает историю Позднего Рима и ранней Византии (начиная с эпохи Диоклетиана и заканчивая византийским императором Маврикием). Наиболее часто эта работа в современной науке подвергается критике из-за того, что основана на литературных и эпиграфических источниках (игнорируя остальные). Археологические исследования этого периода были ещё в зародыше, когда Джонс писал свою книгу, и он объективно не мог включить археологические данные в свой труд.
Первая книга, им опубликованная, The Cities of the Eastern Roman Provinces («Города Восточных провинций Рима») вышла в 1937 году. В 1946 он был зачислен в качестве профессора на факультет Древней истории в Университетский колледж Лондона. В 1951 году он перешёл в Оксфордский университет на такую же должность. В 1947 году Арнольд Джонс был избран членом Британской Академии.
Джонс обладал энциклопедической памятью и способностью к быстрому чтению. Его презрение к «светским беседам» иногда представляло его недосягаемым и холодным для тех, кто его плохо знал, однако он был весьма уважаем своими студентами. Он иногда критиковался за недостаточное знание работ предыдущих исследователей (которые сам давал в подстрочных примечаниях). Этот свой недостаток Джонс знал и извинялся за него в предисловии к своей первой книге.
Он умер от сердечного приступа в 1970, когда плыл на корабле в Салоники для чтения курса лекций.
С момента смерти Джонса известность его труда иногда затмевалась тругими работами о Поздней Античности. Однако этот период практически не был выделен в отдельную область изучения до времени Джонса, и он был одним из основателей исследования периода. Исследователи Поздней Античности часто ссылаются на его работы, и его авторитет как знатока Поздней империи по-прежнему весьма высок.