Во время Великой Отечественной войны командовал подлодкой М-117 Черноморского флота, которая совершила 14 боевых походов (159 суток) и произвела 10 торпедных атак с выпуском 17 торпед. В советское время было принято считать, что М-117 потопила 8 вражеских транспортов и кораблей противника, в том числе три десантных баржи, общим водоизмещением в 20000 тонн, современные источники говорят, что все атаки были безуспешными.
31 мая 1944 года Кесаев удостоен звания Героя Советского Союза, а 22 июля 1944 года М-117 была награждена орденом Красного Знамени.
После войны Кесаев служил в Ленинграде. В 1970 году в звании капитана I ранга ушёл в запас, жил в Севастополе.