Родился в 1794 году в чеченском ауле Беной, в семье крестьянина Баршкъе из рода (некъе)Эди. О периоде жизни Байсангура до 1830-х годов известно крайне мало.
Когда Гази-Мухаммед был провозглашён имамом, сразу же примкнул к его движению. Аул Беной стал опорой Гази-Мухаммада в Чечне. Историк М. Н. Чичагова писала об этом: «Жители этого аула, окружённого лесными дебрями, всегда отличались непокорностью и не скрывали своей ненависти к русским. Они охотно оказали гостеприимство Шамилю» («Шамиль на Кавказе и в России». Спб., 1889 г., с. 59).
Весной 1832 года под Гудермесом чеченцы под командованием Байсангура в конном бою разбили гребенской казачий полк [какой?]. Были захвачены две трофейные пушки, которые чеченцы затем увезли в Беной.
Наиб имама Шамиля. В то время как Шамиль ушел в Дагестан с остатками преданных ему войнов, Байсангур скрывался в лесах Чечни со своим отрядом. Он — один из немногих, кто не прекратил сопротивление войскам Российской империи даже после того как Шамиль был пленен и присягнул на верность императору Александру II.
Через год, Байсангур и бывшие наибы Шамиля Ума Дуев из Дзумсоя и Атаби Атаев из Чунгароя подняли новое восстание в Чечне. В июне 1860 года отряд Байсангура и Солтамурада нанес поражение войскам царского генерал-майора Мусы Кундухова в бою около местечка Пхачу.
Тем временем повстанцы Атаби Атаева блокировали укрепление Евдокимовское, а отряд Умы Дуева освободил аулы Аргунского ущелья. Однако в виду малочисленности (численность не превышала 1500 человек) и плохой вооружённости повстанцев, царские войска быстро подавили сопротивление.
После поражения основных сил повстанцев, Байсангур с несколькими приближенными скрывался в окрестностях села Беной. В одном из боёв под Байсангуром был убит конь и он попал в плен.
Весной 1861 года Байсангур Бенойский был предан военно-полевому суду официальных властей Кавказа, был приговорен к повешению, не дожидаясь исполнения приговора, выбил табурет у себя из-под ног. Могила Байсангура находится в с. Беной. Другие участники восстания, в том числе сыновья Байсангура Алхазур и Тахир, были сосланы в Сибирь.