Выбран Монреаль Канадиенс во втором раунде драфта под 33 номером, в 1987 году. Практически весь свой дебютный сезон в НХЛ 1989-90 годов, пропустил из-за травмы колена. 9 февраля 1995 года, Леклер обменян Канадиенс в Филадельфию Флайерз на Марка Рекки, так же во Флайерз проследовал защитник Эрик Дежарден, ставший впоследствии, как и Леклер, ключевым игроком Филадельфии. Обмененый в Филадельфию Джон Леклер, за время выступления за канадский клуб ничем особо выдающимся не отметился, забив за 5 сезонов всего 49 голов. Каково же было удивление болельщиков и специалистов, когда за оставшиеся 37 игр, Леклер набрал 49 (25+24) очков, а в следующих трех сезонах стабильно забрасывал 50 шайб. Трио 90-х годов Джон Леклер — Эрик Линдрос — Микаэль Ренберг, поражало своей результативностью и недаром получило название — «Легион Смерти» («Legion of Doom»).
Как свободный агент, 15 апреля 2005 года, заключил контракт с Питсбург Пингвинз, где и закончил свою карьеру в 2006 году.