Его работы являются синтезом теологии Альбрехта Ричла, социологической концепции Макса Вебера и неокантианства Баденской школы. Сочинение «Социальные учения христианских церквей» содержит плодотворные идеи в этой области. Разрабатывал понятие секта как творческий период становления религиозной организации.
Изучением наследия Эрнста Трёльча занимается международное общество Ernst-Troeltsch-Gesellschaft, в которое входят теологи, религиоведы, культурологи, историки, философы и социологи.