В 1960-х годах Балибар, учившийся в Высшей нормальной школе, проявил себя как способный ученик и сотрудник философа Луи Альтюссера. Совместно с другими студентами Альтюссера (например, Жаком Рансьером) он принимал участие в семинаре, посвящённом «Капиталу» Карла Маркса, и последующем издании сборника «Читать Капитал». В изданной в 1976 году книге «О диктатуре пролетариата» Балибар критикует руководство Французской коммунистической партии за отказ от концепции революционной диктатуры пролетариата, усматривая корни этого отхода в 1936 году, когда Сталин провозгласил конец классовой борьбы и «общенародное государство» в СССР. В 1985 году выступил с исследованием «Спиноза и политика». В 1989 году совместно с Иммануилом Валлерстайном опубликовал сборник «Раса, нация, класс. Двусмысленные идентичности». В «Массах, классах и идеях» Балибар утверждает, что в «Капитале» исторический материализм Маркса входит в противоречие с его критической теорией, особенно в изучении категории труда. Соответственно, он делает вывод, что формы революционной субъектности не могут постоянно оставаться неизменными (такие формы организации рабочего класса, как политическая партия и профсоюз, также будут рано или поздно исчерпаны).
Дочь философа — актриса и певица Жанна Балибар.