Вульфен родился в Белграде в семье фельдмаршал-лейтенанта Кристиана Фридриха фон Вульфена.
После окончания обучения в Кашау (тогда Венгрия), он в 1745 году вступил в орден иезуитов. Он изучал философию, математику и теологию. С 1755 года он преподавал: в 1755 году в Гориции, с 1756 года в Терезиануме в Вене, в 1761 году в Гориции, с 1762 года в Любляне. В 1763 года он дал обет священства. С 1764 года он преподавал физику и математику в лицее Клагенфурта. С 1769 года он был только духовником. После окончания своей преподавательской деятельности и после упразднения ордена иезуитов в 1773 году он посвятил себя научным исследованиям, особенно ботанике и минералогии. В 1797 году большая часть его коллекций была разграблена французскими оккупантами.
В 1799 и 1800 году Вульфен стал участником восхождения на гору Гросглокнер.
Вульфен был членом академий и научных обществ Берлина, Эрлангена, Йены, Гёттингена, Клагенфурта и Стокгольма. К его многочисленным партнёрам по переписке принадлежали Николаус Жакен и Иоганн Христиан Шребер.
Основной областью исследований Вульфена были Восточные Альпы, флору и флору которых он интенсивно исследовал. Он описал несколько новых видов растений, как цветковые растения, так и тайнобрачные, особенно лишайники. Он часто путешествовал к Адриатике, а также в Голландию.
Другой областью исследований была минералогия. Обнаруженная им в 1841 году жёлтая свинцовая руда была названа в его честь вульфенитом.
К альпийским растениям, впервые описанным Вульфеном относятся:
Водоросли из Адриатики: