Халиду Сиссоко родился 28 августа 1978 года в столице Сенегала — Дакаре. Футболом начал занимться в университетской команде. Первым тренером был местный специалист Ассане Бах.
Футбольную карьеру начал в 1994 году, с выступление в сенегальской команде «Жанна д’Арк». В 2004 году перешёл в бакинский клуб «Баку», цвета которого защищает по сей день. Дебют в составе клуба состоялся 26 сентября 2004 года против команды «Шефа», в котором «банкиры» одержали крупную победу со счётом 3:0. Является гражданином Азербайджана.
Дебютировал в составе национальной сборной Сенегала в 2003 году. Провёл в составе главной сборной страны 19 матчей. Выступал также за молодёжную сборную страны.
По итогам опроса, проведённого интернет порталом www.apasport.az совместно с Профессиональной Футбольной Лигой, Халиду Сиссоко был выбран лучшим вратарём Азербайджана по итогам сезона 2008/09 годов.
Был выбран лучшим игроком XVI тура XVII чемпионата Азербайджана в Премьер-лиге, по итогам опроса, проведённого сайтом Livesport.az среди представителей средств массовой информации.
В сезоне 2006/07 годов 10 игр подряд, в течение 985 минут, продержал свои ворота неприкосновенными, что является вторым лучшим результатом среди вратарей в новейшей истории Азербайджана. Является также обладателем третьего рекорда в 971 минуту.
За время выступления в составе ФК «Баку» четырежды получал красную карточку.
По мнению Сиссоко, лучшим голкипером Азербайджана является Дмитрий Крамаренко.