В 1989—2001 — первый вице-президент Ирана, вначале 8 лет при президенте Рафсанджани, затем ещё 4 — при Хатами. В 2001 (начало второго срока Хатами) его пост занял Мохаммед Реза Ареф.
До вице-президенства Хабиби занимал пост министра юстиции в правительстве Мирхосейна Мусави, в 1979 председательствовал в Совете Культурной революции. Хасан Хабиби принимал участие в написании конституции Исламской республики, а также в написании поправок к ней.
Доктор философии в области правоведения и социологии.