После похорон отца Хильперик поспешил в Брейн (полторы мили от Суассона по дороге к Реймсу) и заставил стражу королевского поместья выдать себе ключи от сокровищницы. Овладев богатством, он подкупил начальников дружин и воинов. Те принесли ему клятву верности и признали королём. Во главе войска он отправился в Париж и захватил его, не встретив сопротивления. Остальные три брата Хариберт I, Гунтрамн и Сигиберт I объединились и с превосходящими силами двинулись на Париж. Хильперик не решился выступить против них и согласился на полюбовный раздел королевства по жребию. Хильперику досталось Королевство Суассонское, которое франки впоследствии называли Нейстрия.
Воспользовавшись тем, что его брат Сигиберт I воевал с аварами, Хильперик нарушил клятву, напал на Реймс и овладел им, как и несколькими другими городами. Однако, Сигиберт, одержав победу в походе за Рейном, вернулся и овладел Суассоном и, найдя там Теодеберта, сына короля Хильперика, взял его в плен. Потом, выступив против Хильперика, он дал ему сражение, обратил его в бегство и подчинил себе подвластные ему города. Теодеберт же оставался пленником целый год в Понтионе. Затем Сигиберт, будучи милосердным, возвратил его отцу живым и здравым, одарив при том подарками; но Теодеберт дал клятву никогда ничего не предпринимать против него (впрочем, неоднократно нарушенную впоследствии). После чего оба брата помирились, и Хильперик даже присоединился к Сигиберту в походе того против народов саксонской федерации.
Хильперик не выносил власти духовенства. Женат Хильперик был на Аудовере. На службе у последней находилась некая Фредегонда. Хильперик, полюбив Фредегонду, женился на ней, а бывшую жену отправил в монастырь. От своей доверчивой госпожи Фредегонда избавилась остроумным и коварным способом: когда Хильперик находился в отсутствии, Аудовера родила ему дочь, и Фредегонда посоветовала королеве самой окрестить ребенка, не затрудняя себя поисками крестной матери. Вернувшийся Хильперик воспользовался законным предлогом, чтобы разорвать брак: ведь Аудовера стала ему кумой и теперь не имела права оставаться его супругой. Было же тогда у Хильперика от его первой жены Аудоверы три сына: Теодоберт, Меровей и Хлодвиг.
Затем, по примеру своего брата Сигиберта, женившегося на вестготской принцессе Брунгильде, Хильперик попросил руку старшей дочери короля вестготов Атанагильда — Галесвинты. Однако, Атанагильд, наслышанный о распутном характере этого франкского короля, не торопился отдавать свою дочь за него. Переговоры затянулись и продолжались до 567 года, когда умер старший брат Хильперика Хариберт I. Парижское королевство было поделено между оставшимися тремя братьями. Хильперик получил Лимож, Кагор, Дакс, Бордо, Бигорр, Беарн и несколько кантонов в Верхних Пиренеях. Таким образом, король Нейстрии, не имевший ни одного города южнее Луары, стал ближайшим соседом короля вестготов, что ускорило брак между ним и дочерью Атанагильда. Пообещав Галесвинте в качестве свадебного подарка города Лимож, Кагор, Бордо, Беарн и Бигорр и, обещая удалить от себя Фредегонду, Хильперик женился на ней (март 567? года). Однако быстро охладел к ней и приказал тайно её убить. Галесвинта была задушена во сне, а Хильперик вновь вернул себе Фредегонду (ок. 568 года).
С этого времени началась серия продолжавшихся полвека династических войн, получивших название «войн Фредегонды и Брунгильды». Возмущенная королева Австразии Брунгильда решила отомстить за сестру, и король Сигиберт I, на которого она имела огромное влияние, двинул войска на брата-клятвопреступника. Но нормы кровной мести были уже смягчены обычным правом. При посредничестве третьего брата, короля Гунтрамна, было созвано общенародное судебное собрание (569 год), которое постановило, что в качестве пени за убийство виновный в нём Хильперик должен передать королеве Брунгильде, как сестре Галесвинты, пять городов в Аквитании: Бордо, Лимож, Кагор, Беарн и Бигорр.
Мир был восстановлен, но оказался недолгим, потому что вероломный Хильперик не собирался соблюдать его условия. Он решил вознаградить себя за территориальные потери, отобрав силой у Сигиберта другие южные города — Тур и Пуатье. Войны между братьями возобновились, и разгневанный Сигиберт счёл, что он должен покончить с преступным братом и присоединить к своим владениям его земли. На стороне короля Австразии было военное преимущество: надежда на богатую добычу привлекла на его сторону ополчения многих языческих германских народов из-за Рейна. Северная Галлия вновь испытала опустошительное нашествие тех племен, которых романизирующиеся западные франки уже воспринимали как варваров. В борьбе с австразийцами пал старший сын Хильперика Теодоберт. Охваченный страхом Хильперик заперся в Турне и был осаждён там войсками Сигиберта, который уже провозгласил себя королём Нейстрии.
В Турне, осажденном австразийскими войсками, Фредегонда родила сына. Новорождённый был окрещён епископом Турне, причём, вопреки франкским обычаям, получил чуждое германскому языку имя Самсон, которое его родители, бедствуя, избрали в предзнаменование своего освобождения. Считая положение своё почти безнадёжным, король ждал развязки с каким-то бесстрастием; но королева, не столь слабая духом, подговорила двух людей убить Сигиберта. Те, под видом перебежчиков, добрались до Витри и убили Сигиберта, сами пав от рук его стражников (575 год). Потерявшее вождя войско быстро распалось, и Хильперик легко вернул себе утерянные владения. Занял он и Париж, где захватив Брунгильду, отправил ее в изгнание в город Руан, а ее сокровища, которые она привезла в Париж, он отнял. Дочерей Сигиберта он приказал держать в городе Мо.
В 576 году Хильперик послал своего сына Меровея с войском против Пуатье, но тот, оставив без внимания приказ отца, прибыл в дни Святой Пасхи (то есть 5 апреля) в Тур. Его войско сильно опустошило эту область. Сам же он, делая вид, что хочет поехать к своей матери Аудовере, отправился в Руан, где встретился с королевой Брунгильдой и женился на ней, что противоречило каноническим законам церкви, так как он женился на жене своего дяди. Такой поворот дел сильно рассердил Хильперика, и он лично выехал, чтобы встретиться с сыном. После продолжительных переговоров Хильперик сделал вид, что уступил просьбам сына, хотя и остался при своём мнении.
Между тем, какие-то люди из Шампани напали на Суассон и изгнали из него королеву Фредегонду и Хлодвига, сына Хильперика. Хильперик и Меровей выступили на Суассон. Вперед Хильперик послал послов с призывами к мирным переговорам. Но переговоры сорвались, и произошло сражение. Хотя Хильперик и победил, и вступил в Суассон, но он начал подозревать, что это сражение произошло по вине Меровея, из-за его связи с Брунгильдой. Меровей был обезоружен и отдан под стражу.
После чего Хильперик послал одного из своих приближенных Рокколена с людьми из города Ле-Ман в Тур с требованием выдать ему Гунтрамна Бозе, которого он обвинял в смерти своего сына Теодоберта. Гунтрамн Бозе укрылся в базилике Святого Мартина, и Рокколен требовал от жителей выгнать его оттуда, в случае неповиновения грозя предать огню город и все его окрестности. Жители Тура во главе со своим епископом Григорием Турским отвечали, что то, чего он требует, никогда не делалось с давних времен и никоим образом нельзя допустить поругания святой базилики, пользующейся статусом неприкосновенности. Так ничего и не добившись от жителей, Рокколен заболел желтухой, уехал в Пуатье и там умер.
Тогда Хильперик отправил против Тура своего сына Хлодвига. Последний захватил Турскую и Анжерскую области до самого Сента. Полководец бургундского короля Гунтрамна Муммол дошёл до Лиможа и сразился с Дезидерием, герцогом короля Хильперика. Муммол потерял 5 тысяч воинов, Дезидерий же — 24 тысячи и сам едва спасся. Муммол вернулся обратно в Бургундию через Овернь и частично опустошил эту провинцию.
По приказу Хильперика Меровей был лишен прав наследства; его постригли в монахи и отправили в монастырь Анинсола (впоследствии Сен-Кале) в Ле-Мане, но тот по пути был освобожден людьми Гунтрамна Бозе, и они укрылись в Туре, в базилике Святого Мартина (577 год). Хильперик послал в Тур войско, требуя выдать ему Меровея. Вся область была опустошена, разграблена и предана огню. Епископ руанский Претекстат, который обручил Меровея с Брунгильдой, был схвачен по приказу Хильперика, обвинён в нарушении канонических законов и подстрекательстве народа с помощью денег, полученных от Брунгильды, к неповиновению королю. Претекстат был предан церковному суду и, несмотря на заступничество многих епископов, в том числе и Григория Турского, под давлением короля был признан виновным. Претекстата лишили епископской должности и посадили в темницу, а когда он попытался ночью оттуда бежать, его очень сильно избили и сослали на остров, расположенный в море, близ города Кутанса (вероятно, остров Джерси).
Меровей бежал в Австразию к Брунгильде. Австразийская знать, правившая от имени малолетнего короля Хильдеберта II, видимо, не желая усиления власти Брунгильды в случае её прочного союза с Меровеем, отказала ему в убежище. Меровей скрылся в Реймсе, не показываясь открыто австразийской знати, но попал в засаду, устроенную людьми из Теруана. Они сказали ему, что если он к ним придёт, то они, оставив отца его Хильперика, перейдут в подчинение ему. Взяв с собой самых храбрых людей, Меровей быстро отправился к ним. А те окружили его в какой-то вилле и, расставив вокруг неё вооруженных людей, отправили гонцов к его отцу. Хильперик срочно выехал туда, где Меровей содержался под стражей, но тот уже был убит неким Гайленом. Вероятно, тут не обошлось без происков Фредегонды, задумавшей извести всех детей Аудоверы. Прибывшему Хильперику осталось лишь казнить убийцу. Гайлена схватили, отрубили ему руки и ноги, отрезали уши и нос и, подвергнув его другим многочисленным пыткам, убили безжалостным образом. Гриндиона же колесовали и тело его насадили на кол. Циуцилона, который некогда был дворцовым графом короля Сигиберта, убили, отрубив ему голову. И многих других, которые пришли с Меровеем, умертвили, подвергнув жестоким пыткам. Тогда ещё рассказывали, что в этих предательских кознях главную роль сыграли епископ Эгидий и Гунтрамн Бозон — потому что Гунтрамн из-за убийства им Теодоберта тайно пользовался расположением королевы Фредегонды, а Эгидий же потому, что уже с давнего времени был ей дорог.
В 577 году от дизентерии умер сын Хильперика и Фредегонды Самсон, которому едва исполнилось два года; сама Фредегонда тоже заболела, но поправилась. Гунтрамн Бозе прибыл с немногими вооруженными людьми в Тур, силой увёл своих дочерей, укрывающихся в Святой базелике, и переправил их в Пуатье, принадлежащий королю Хильдеберту II. Затем, оставив своих дочерей в церкви блаженного Илария в Пуатье, он отправился к королю Хильдеберту. Но Хильперик захватил Пуатье, и его воины обратили в бегство людей его племянника. В 578 году Гунтрамн Бозе вновь вернулся в Пуатье и увез своих дочерей, причём ему пришлось убить герцога Пуатье Драколена, пытавшегося помешать этому. После этого тесть Гунтрамна Бозе Север был схвачен и отправлен в заключение, где его и настигла наихудшая смерть. Оба его сына, Бурголен и Додон, погибли, осужденные на смерть за оскорбление величества; один был убит толпой, другой, захваченный при бегстве, скончался после того, как у него отрубили руки и ноги. Имущество же их и имущество их отца было передано казне, ибо у них было большое богатство.
В 578 году Хильперик замыслил поход в Бретань. В походе принимали участие воины из Тура, Пуатье, Байё, Ле-Мана и Анжера. Король Бретани Варош II ночью напал на воинов из Байё и перебил большую их часть, но затем он заключил мир с герцогом, командующим войсками короля Хильперика, поклялся в верности королю Хильперику и послал к нему в качестве заложника своего сына. Кроме того, он возвратил город Ванн с тем условием, что если король разрешит ему управлять им, то он будет ежегодно выплачивать без всякого напоминания дань и присылать всё то, что королю причитается. После этого войско было выведено из той местности.
В 579 году Варош II нарушил клятву и сильно опустошил область Ренна. Против него выступил герцог Бепполен, который огнём и мечом начал приводить бретонцев к покорности, что вызвало у них ещё большую ярость, и они вновь напали на города Нант и Ренн и унесли огромную добычу, опустошили поля, собрали виноград с виноградников и увели пленных.
В 579 году Хильперик, по инициативе Фредегонды, решил провести перепись населения, с целью увеличить сбор налогов. Кроме того, были введены новые налоги на поля, леса, дома, скот, виноградники и тому подобное, что вызвало резкое недовольство населения, вылившееся в открытое восстание в Лиможе. В феврале 580 года в Лимож, с целью контроля проведения переписи населения, прибыл референдарий Марк, галло-римлян по происхождению. 1 марта горожане подняли восстание. Марку удалось бежать из города, и он тут же написал Хильперику о бунте. Хильперик выслал войска. Королевские комиссары прибыли в Лимож и, после короткого расследования обстоятельств, учинили расправу. Лиможские сенаторы, а также все знатные граждане были отправлены в изгнание. Аббат и священники, обвинённые в подстрекательстве народа к сожжению реестровых книг, были подвергнуты различного рода пыткам на городской площади. Всё имущество казнённых и изгнанных отошло в казну, а город был обложен чрезвычайным налогом, значительно более обременительным, чем те налоги, которые он раньше отказался платить. Введенные в Нейстрии налоги были столь тяжелы, что многие отказывались от своих наследственных владений, покидали Нейстрию и устремлялись в города подвластные Хильдеберту II и Гунтрамну.
К тяжелому финансовому положению населения прибавились стихийные бедствия, постигшие Нейстрию. Весной 580 года Рона, Сона и Луара из-за непрерывных дождей вышли из берегов и произвели огромные опустошения. Вся долина Оверни была затоплена, а в Лионе много домов было разрушено, и обвалилась часть городской стены. Летом буря с градом опустошила территорию Буржа; город Орлеан был наполовину уничтожен пожаром; в Бордо случилось сильное землетрясение, расшатавшее даже городские стены. Наконец, в августе вспыхнула эпидемия оспы, охватившая почти всю Галлию, от которой заболел даже Хильперик и его сыновья от Фредегонды — Хлодоберт и Дагоберт. Хильперик выздоровел, но оба его сына умерли. Во время болезни сыновей Хильперик и Фредегонда, пытаясь добиться божьей милости, отменили введенные налоги и сожгли реестровые книги; потом король Хильперик раздал много подарков церквям, базиликам и бедным людям.
Наследником престола остался последний сын Хильперика от Аудоверы — Хлодвиг. Фредегонда, верная своей мысли извести всех сыновей Хильперика от Аудоверы, продолжала плести интриги, в ходе которых очернила Хлодвига. Она обвинила перед мужем Хлодвига в причастности к колдовству, из-за которого и умерли её дети; колдуньей же была якобы мать его наложницы. Женщину сожгли на костре, а принц был выслан под стражей на одну виллу, где его вскоре нашли убитым — видимо, по приказу Фредегонды, а королю сказали, что Хлодвиг сам заколол себя (октябрь 580 года). Затем, также по приказу Фредегонды, в своём монастыре была убита Аудовера, а её дочь Базина изнасилована и отправлена в монастырь в Пуатье. Домены, которые получила Аудовера при разводе, а также другие её владения и всё, что принадлежало Хлодвигу и его сестре Базине, перешло в собственность Фредегонды.
В 581 году между королями Гунтрамном и Хильдебертом II возник раздор из-за спора по поводу владения частью Марселя, после смерти короля Сигиберта уступленного Гунтрамну в качестве платы за опекунство над малолетним Хильдебертом. Когда король Хильперик увидел, что эти распри между его братом и племянником увеличиваются, он призвал герцога Дезидерия и приказал ему чем-нибудь досадить брату. Выступив с войском, Дезидерий обратил в бегство герцога Гунтрамна Рагновальда, захватил Перигё и, взяв с жителей присягу, пошёл на Ажен и взял все города, которые в Аквитании принадлежали королю Гунтрамну, и отдал их под власть короля Хильперика. Когда герцог Берульф услышал о том, что жители Буржа, который тогда входил в королевство Гунтрамна, тайком поговаривают о вторжении в область, он двинул войско и расположился на самой границе. В то время сильно разграбили окрестности Изёра и Барру в области Тура. А герцог короля Хильперика Бладаст вторгся даже в Страну басков, но потерял там большую часть своего войска.
В 582 году возвратились послы короля Хильперика, отправленные в Испанию для осмотра выкупа, который вестготский король Леовигильд по старо-германскому обычаю давал за дочь Хильперика Ригунту, помолвленную с младшим сыном короля вестготов Реккаредом. Вслед за этим посольством прибыло к королю Хильперику и посольство из Испании. Король Леовигильд, который в это время вёл борьбу со своим старшим сыном Герменегильдом, которого поддерживал Гунтрамн, стремился заручиться поддержкой Хильперика. С этой же целью послы после успешных переговоров с Хильпериком, направились и к Хильдеберту и, добившись своей цели и там, возвратились в Испанию.
В 582 году у Хильперика родился сын Теодорих. В честь этого король приказал открыть все тюрьмы, освободить заключенных, отдал распоряжение совсем не требовать недоимки, подлежащие выплате казне. Но это радостное событие вызвало разрыв в отношениях Хильперика с Хильдебертом II. В 583 году герцоги Хильперика Берульф, Дезидерий и Бладаст со своими войсками вторглись в область Бурж, поддерживающую Хильдеберта. Буржцы собрали 15 тысяч войска и выступили навстречу. У крепости Шатомейан они сразились с герцогом Дезидерием. Последний потерял в этом сражении более 7 тысяч убитыми. Остальные герцоги, грабя и убивая всё и всех на своём пути, дошли до Буржа и осадили его. На выручку Буржа поспешил с войском Гунтрамн и уничтожил большую часть войска брата. Хильперик запросил мира.
В 584 году сын Хильперика Теодорих заболел дизентерией и умер, когда ему было два года. В его смерти был обвинен префект Муммол. Он был схвачен и подвержен страшным пыткам, но ни в чём не сознался. Его отпустили, но он вскоре умер. Хильдеберт II и Гунтрамн возобновили свой союз против Хильперика, и последний был вынужден укрыться в Камбре. В эти дни у него родился сын Хлотарь.
1 сентября 584 года Хильперик снарядил богатый караван со своей дочерью Ригунтой (Риккунтой), которую он отдавал за Реккареда — младшего сына короля вестготов Леовигильда. После этого он отправился на виллу Шелль, недалеко от Парижа, чтобы поучаствовать в охоте. К тому времени отношения между супругами были испорчены. Король подозревал королеву в измене с графом Парижа Ландрихом (Ландериком). 27 сентября, при возвращении с охоты, Хильперик был убит каким-то человеком, который два раза всадил в него нож когда он слезал с лошади.
Убийцу так и не нашли. Репутация у Фредегонды была такой, что её сразу же начали подозревать в организации убийства. В «Книге истории франков» прямо говорится, что король, собираясь на охоту, уже от конюшен ещё раз вернулся в покои Фредегонды, где она как раз мыла в воде голову. Король же приблизился к ней сзади и шлепнул её палочкой по заду. Думая, что это Ландерих, она сказала: «Что ты там делаешь, Ландерих?». Развернувшись и увидев, что это был король собственной персоной, она сильно испугалась. Король весьма сильно опечалился и ушёл охотиться. А Фредегонда позвала Ландериха к себе, поведала ему, что сделал король, и вместе они решили подослать к нему убийц, а затем обвинить в этом убийстве короля Хильдеберта II . Но против этого хода развития событий говорит то, что непосредственных выгод от смерти мужа королева не получила — напротив, ей пришлось сразу же вместе с четырехмесячным сыном Хлотарём укрываться в Парижском соборе и просить о покровительстве деверя, Гунтрамна Бургундского. Согласно Фредегару, Хильперих I был убит неким Фалко по наущению Брунгильды. Григорий Турский не обвиняет ни одну из враждовавших королев.
Малульф, епископ Санлиса, тогда как раз обретавшийся при королевском дворе, приказал перенести тело короля, обрядив в королевские одежды, на корабль, и затем они с духовными песнями и распеванием псалмов погребли его в присутствии королевы Фредегонды и войска в городе Париж, в церкви святого мученика Винцентия (современный Сент Жермен-де-Пре). Герцог Дезидерий, узнав о смерти Хильперика, ограбил караван его дочери Ригунты, а её саму заключил в каком-то доме.
Григорий Турский крайне негативно отзывается об этом короле:
Единственное сохранившееся стихотворение Хильперика является ритмическим гимном. О необычайной любознательности этого франкского короля и о его, по-видимому, искреннем влечении к образованности говорит и поэт Венанций Фортунат в одном из своих стихотворений, посвященном Хильперику (IX, I):
Хильперик I правил 23 года. В историю вошёл один из эдиктов Хильперика I, поскольку он изменил главу «Салической правды» «Об аллодах» и установил, что в случае отсутствия сына землю могут наследовать дочь, брат или сестра умершего, но не община или соседи-общинники, то есть право наследования было признано и за потомками женского пола. Земля превратилась в аллод. Её можно было завещать, дарить, а затем и продавать. Права общины распространялись теперь только на земли альменды.
Фредегонда же правила государством вместе с малолетним королем Хлотарем, ее сыном, и вместе с Ландерихом, которого избрали майордомом двора. Франки же сделали упомянутого малолетнего короля Хлотаря своим властителем.