Хосе Хоакин де Ольмедо родился в 1780 году в городе Гуаякиль. Учился в Перу.
В юности писал анакреонтическую и буколическую лирику, создал лиро-эпическую поэму «Победа при Хунине». «Песнь Боливару» (опубликована в 1825 году), которая принесла ему широкую известность..
Активно участвовал в борьбе за независимость Эквадора.
9 октября 1820, Ольмедо и поддерживающие его патриоты объявили независимость Гуаякиль от Испании. Ольмедо был единственным президентом Свободного государства Гуаякиль. Впоследствии эта территория всё же была включена Симоном Боливаром в состав Великой Колумбии.
В 1830—1831 гг. был вице-президентом Эквадора.
После свержения президента Хуана Хосе Флореса в июне 1845 года Хосе Хоакин де Ольмедо стал председателем Временного правительства Эквадора. Свой пост он оставил 8 декабря 1845 года, передав полномочия Висенту Рамону Рока.
В честь Хосе Хоакина де Ольмедо назван футбольный клуб из города Риобамба, чемпион Эквадора 2000 года.
Эквадорский поэт Хосе Ольмедо удостоился чести быть увековеченным в камне у себя на родине. Но, учитывая скудные финансы, правительство Эквадора приняло решение приобрести подержанную статую английского поэта Байрона.