Родился на Майорке (Испания), в крестьянской семье, его родным языком был каталонский. Его интерес к религии проснулся в 13 лет, когда он изучил книгу по оккультизму. Найдя ее слишком запутанной, он взялся за старый английский перевод Бхагавад Гиты. Это вдохновило его изучать санскрит, чтобы лучшее понять текст, поскольку доступный перевод был весьма плох.
Женился на Кэтлин Эллис в 1951 и имел близнецов: сына и дочь. Он использовал испанское имя Хуан (Juan), потому что его каталонское имя Джоан (Joan) в английском языке является женским.
В 1967 году Маскаро был среди гостей передачи Дэвида Фроста о медитации с Джорджем Харрисоном и Джоном Ленноном. Позже Маскаро отправил Харрисону письмо со своей работой «Lamps Of Fire», особо отметив главу 47 из книги «Канон Пути и его Благой Силы», предложив написать музыку по его мотивам. Так, с легкой руки Хуана Маскаро, основоположник даосизма Лао-цзы стал соавтором знаменитой четверки.
Маскаро вёл обширную переписку, среди его адресатов были Харрисон, Д. Алонсо, Х. Гильен, С. де Мадарьяга, Л. Сернуда, Р. Паниккар.
Некоторые из изданий работ Хуана Маскаро: