Окончил Харьковский юридический институт (1985), Всероссийский заочный финансово-экономический институт (1997).
Весной 2005 Кондрат лично вылетел в Ненецкий автономный округ, где инициировал возобновление прекращённых ранее уголовных дел в отношении губернатора округа Алексея Баринова, обвинявшегося в злоупотреблении положением и присвоении вверенного имущества. Вскоре после этого Баринов был арестован, освобождён от занимаемой должности, а в 2007 приговорён к трём годам лишения свободы условно. Сам Баринов и его сторонники считали, что дело носило «заказной» характер.
По данным «Коммерсанта», Кондрат являлся протеже генерального прокурора Владимира Устинова, но не вписался в команду его преемника Юрия Чайки. В сентябре 2006 Чайка посетил Петербург, при этом демонстративно отказавшись встретиться с Кондратом. Вскоре после этого Кондрат ушёл на больничный, отказываясь уходить в отставку («Коммерсант» утверждает, что «по неофициальной информации из Генпрокуратуры, тогда ему в категоричной форме предложили написать заявление об уходе по собственному желанию, но он этого делать не хотел»). Затем была инициирована проверка информации о деятельности Кондрата, а сам он был переведён в Москву на номинальную должность заместителя генпрокурора по особым поручениям. После этого Кондрат подал заявление об отставке. Впрочем, по данным пресс-службы Генпрокуратуры, «Иван Николаевич сам написал рапорт с просьбой уволить его на пенсию, так что не надо искать тут какие-то подводные камни».
В 2007 Кондрат был назначен руководителем управления Федеральной регистрационной службы (ФРС) по Москве — главным государственным регистратором Москвы (ФРС находится в ведении министерства юстиции, которое в 2006 возглавил Владимир Устинов).