Карл Вильгельм Аммон родился в 1777 году в Пруссии (ныне город Ясная Поляна (Калининградская область)), близ имевшего мировую славу конезавода Тракенен (что вероятно и повлияло на выбор им профессии).
Изучал ветеринарию в столице Германии городе Берлине, а с 1754 года уже занимался самостоятельной практикой (там-же).
В 1797 году занимал должность ветеринарного врача при различных конских заводах.
В 1839 году, по выходе в отставку, поселился в Ансбахе, где и скончался в 1842 году.