Изучал в Вюрцбургском университете естествознание, в том числе зоологию; в 1858 отправился в Манилу и пробыл на Филиппинских островах до 1861; в 1862 посетил острова Палау, в 1864 — Минданао; в 1868 стал профессором зоологии и сравнительной анатомии в Вюрцбурге, в 1872 также директором основанного только что Зоологическо-зоотомического института, в 1877 объездил Северную Америку.
Труды:
С 1872 Земпер издавал "Arbeiten aus dem zoologisch-zootomischen Institut in W?rzburg".