Дебютировал в июле 2000 года.
В декабре 2003 года проиграл нокаутом в 8-м раунде Мигелю Анхелю Котто.
В декабре 2004 года Маусса уступил по очкам малоизестному Артуро Моруа.
В июне 2005 года Карлос Маусса вышел на ринг против чемпиона мира в 1-м полусреднем весе по версии WBA Вивиана Харриса. В начале 7-го раунда колумбиец встречным левым хуком попал в челюсть Харрису. Тот попятившись, упал на канвас возде канатов. Маусса добавил по лежащему противнику еще сверху правый свинг, который пришёлся в канат. Рефери оттащил колумбийца от чемпиона. Харрис не успел поднятся на счёт 10. Рефери зафиксировал нокаут. Поединок проходил в рамках шоу, организованного телеканалом HBO, главным событием которого был бой Флойд Мейвезер - Артуро Гатти.
В ноябре 2005 года Маусса был нокаутирован в 9-м раунде в объединительном поединке чемпионом мира в 1-м полусреднем весе по версии IBF Рикки Хаттоном
В августе 2006 года колумбиец проиграл по очкам малоизвестному Мануэлю Гарнисе.
В ноябре 2007 года Карлос Маусса встретился с Виктором Ортисом. В середине 1-го раунда левым кроссом Ортис, попав Мауссе в челюсть, послал его на канвас. Маусса не смог подняться на счет 10, и рефери остановил бой. Поединок проходил в рамках шоу, организованного телеканалом HBO, главным событием которого был бой Мигель Анхель Котто - Шейн Мосли.