Карлтон Кьюз родился 22 марта 1959 года в Мехико. Родившись в Мексике, Кьюз рос в Бостоне и Оранж Каунти, Калифорния. Кьюз был воспитанником школы Патни. Затем он поступил в Гарвардский университет, окончив университет со степенью по американской истории.
Свою карьеру в полнометражных фильмах Кьюз начинал, работая ассистентом продюсера. Затем он стал партнёром сценариста Джеффри Боама. Их тандем внёс свой вклад в фильмы «Смертельное оружие 2», «Смертельное оружие 3» и «Индиана Джонс и последний крестовый поход». На телевидение Кьюз начал работу в сериале Майкла Манна «Криминальные истории». Он стал одним из создателей и исполнительным продюсером успешного среди критиков сериала «Приключения Бриско Каунти-младшего». Карлтон Кьюз также является создателем и исполнительным продюсером всех шести сезонов сериала «Детектив Нэш Бриджес».