Детство Кайсы прошло в небольшой деревне Ристиярви в центральной части Финляндии. Там же в четырехлетнем возрасте она впервые приняла участие в лыжных соревнованиях. Решение перейти в биатлон Кайса приняла спустя 16 лет, в 2003 году. В этом же году состоялась её первая гонка в качестве биатлонистки. Показав хорошие результаты на биатлонных соревнованиях Финляндии, Кайса становится членом сборной Финляндии по биатлону.
Первым международным стартом Кайсы становится юниорский чемпионат мира сезона 2003/2004. В своей первой гонке Кайса показала 23-й результат, допустив 7 промахов на четырех огневых рубежах, 4 из которых пришлись на последнюю стрельбу. В следующей гонке биатлонистка показывает 51-й результат из 57-ми спортсменок. В гонке преследования, которая стала финальной в сезоне для Мякяряйнен, Кайса поднимается на 12 пунктов, финишируя 39-й. На этом выступления Кайсы в этом сезоне заканчиваются, и она продолжает подготовку в национальной команде к следующему сезону.
Сезон 2004/05 начинается для Кайсы участием во взрослом чемпионате мира по биатлону в Хохфильцине. Приняв участие в двух личных гонках, Мякяряйнен не попадает в топ-40, финишируя 49-й в индивидуальной гонке и 73-й в спринте. Также в этом сезоне Кайса впервые попадает в эстафетный квартет, где выступает хуже всех в команде, отправляясь на 2 штрафных круга, финишировав в итоге 18-й.
В целом дебютные выступления для Кайсы сложились неудачно.
В сезоне 2005/06 Кайса выступает практически во всех гонках, пропуская по собственному решению только индивидуальную гонку Хохфильцена и гонку преследования Антхольца. В этом же сезоне Кайса впервые в своей карьере зарабатывает очки Кубка мира, финишируя 29-й уже во второй личной гонке. Наиболее успешным выдался 5-й этап Кубка мира, когда Мякяряйнен дважды попадает в топ-30, показывая свой лучший результат в карьере — 23-е место, показав при этом 32-е время прохождения дистанции. По итогам сезона Кайса становится одним из лидеров сборной, прочно закрепляясь в эстафетном составе Финляндии, вместе с которым ей удалось впервые попасть в топ-10 в эстафетных гонках Оберхофа и Рупольдинга. По результатам сезона Мякяряйнен выбирают лучшей спортсменкой Финляндии 2006-го года.
В общем зачете Кубка мира Мякяряйнен становится 62-й, показывая лучший результат среди всех финских биатлонисток, но этого недостаточно для попадания на Олимпиаду в Турине и Кайса её пропускает.
В самой первой гонке сезона от первого попадания в десятку Кайсу отдалили лишь три секунды: допустив 2 промаха на четырех огневых рубежах, спортсменка финишировала 11-й, отстав от победительницы менее чем на 2 минуты. Следующие индивидуальные гонки сезона также проходили успешно: Кайса не опускалась ниже 11-го места и, пропустив одну гонку, стала 8-й в зачете малого кубка по программе индивидуальных гонок. Этот результат Кайса сможет улучшить только спустя 4 года. В этом же сезоне Кайса впервые попала в десятку лучших в спринте, показав десятое время в Хольменколлене. Этот же сезон стал одним из самых лучших для Мякяряйнен за все время в плане стрельбы. В индивидуальных гонках спортсменка смогла закрыть 54 мишени из 60, показав очень высокую точность в 90 %.
На этом успехи не закончились, Кайса впервые попала в ТОП-30 общего зачета, регулярно попадая в масс-старты. Но не самый быстрый ход и не самая точная стрельба позволили финке попасть выше 24-го места в масс-стартах лишь однажды — Кайса финишировала 7-й на чемпионате мира, показав при этом 5-й ход на дистанции. По итогам сезона Мякяряйнен становится единственной представительницей Финляндии, набравшей кубковые очки, и занимает 27-е место.
После завершения сезона, Кайса впервые приняла участие в летнем чемпионате мира в эстонском Отепя. Самая первая кроссовая гонка сложилась для Кайсы неудачно: допустив 5 промахов на последней стрельбе, Мякяряйнен поделила 18-е место со своей подругой по команде. Но уже через 3 дня Кайса смогла одержать победу в спринтерской гонке, а ещё через день сохранить свою позицию в гонке преследования, на финише опередив украинку Татьяну Рудь на 4 десятых секунды.
Проведя активные тренировки во время межсезонья, Мякяряйнен смогла заметно увеличить свою скорость, став одной из быстрых спортсменок, попадая в десятку самых быстрых во многих гонках. Это отрицательно сказалось на стрельбе: если в прошлом лучшие результаты Мякяряйнен показывала в индивидуальных гонках, всегда финишируя в топ-15, то в этом сезоне спортсменка не смогла подняться выше 20-го места. Серьёзно сдав позиции в индивидуальных гонках (с 8-го на 43-е место в зачете малого кубка), Кайса смогла все с лихвой окупить успешными результатами в спринтерских гонках и гонках преследования, в итоге совершив скачок с 29-го на 10-е и с 47-го на 15-е места соответственно в зачете малых кубков.
Повышение скоростных кондиций позволило Кайсе финишировать в десятке сильнейших в пяти спринтерских гонках из девяти, в которых она принимала участие, и дважды попасть на подиум, завоевав свое первое серебро спринта и первую бронзу преследования в Поклюке и Рупольдинге.
На чемпионате мира Кайса не смогла себя проявить, показав в спринте самый худший результат за 2 года (55-е место) и допустив при этом 3 промаха, скорость Кайсы на трассе была 34-й. В масс-старте и индивидуальной гонке Мякяряйнен также не смогла показать высоких результатов, заняв 31 и 15-е места.
Спортсменка завершила сезон на 13-м месте в общем зачете, набрав 388 очков.
Начало сезона 2008/2009 складывается для спортсменки не так удачно: за первые 2 этапа Кайса попадает в очковую зону лишь дважды, занимая 35 и 34 места в эстерсундском спринте и преследовании. Третий этап Кубка мира складывается удачно. Уже в начале этапа Кайса показывает свой лучший результат в индивидуальных гонках: седьмое место. В спринте Кайса показывает 3-й ход по дистанции и с одним промахом занимает четвертое место. Успешные выступления продолжаются ещё 3 этапа, и к чемпионату мира Мякяряйнен подходит с двумя подиумами: 2-е место в гонке преследования и 2-е место в масс-старте шестого этапа.
Спринт чемпионата мира складывается не самым лучшим образом: Кайса показывает 23-й результат с тремя промахами и отставанием в две минуты. В гонке преследования Кайса показывает хорошую стрельбу, допуская 2 промаха, и вплотную приближается к лидерам. Мякяряйнен финиширует в шаге от подиума, занимая 4-е место. Конец сезона получается не самым лучшим образом. Мякяряйнен занимает места во втором и третьем десятке, заканчивая сезон на 14-м месте в общем зачете Кубке мира, набрав 577 очков.
В конце сезона, Мякяряйнен, получая серьёзную травму колена, думает о завершении карьеры:
В межсезонье Кайса делает операцию на глаза с целью улучшить свое зрение. По словам Кайсы, из-за проблем со зрением она допускала промахи и проводила много времени на рубеже, что мешало показывать лучшие результаты.
Для Мякяряйнен начало Олимпийского сезона складывалось многообещающе: в первых же гонках Кайса попадает на подиум, занимая 3-е место в спринте, опередив Хелену Экхольм на 1 десятую секунды. Однако за все оставшиеся гонки Кайса смогла попасть в десятку лишь однажды, заняв 9-е место в спринте на третьем этапе.
На Олимпийских играх Кайса показывает наихудшие результаты в сезоне, не заработав ни одного очка. 46-е место в индивидуальной гонке, 59-е в спринте и 45-е в преследовании не позволяют Мякяряйнен попасть в Ванкуверский масс-старт. Причиной столь неудачного выступления становится желудочно-кишечная инфекция, подхваченная спортсменкой незадолго до начала Олимпийских игр.
Кайса заканчивает сезон на 22-м месте общего зачета Кубка мира, набрав 418 очков.
В сезоне 2010/2011 Мякяряйнен совершает резкий скачок, заметно улучшив стрелковые качества и покинув 10-ку сильнейших только 5 раз за все личные гонки. Первая гонка сезона складывается неплохо: допустив 4 промаха, Мякяряйнен финиширует 11-й, показав при этом самый быстрый ход на дистанции. Чистая и быстрая стрельба в следующей гонке позволила Кайсе одержать первую победу, показав второе время по скорости (Мякяряйнен уступила 3 секунды лишь лыжнице Мириам Гёсснер). В гонке преследования Кайса демонстрируют свою самую лучшую стрельбу, отстреляв на ноль, и вновь занимает первое место, опережая ближайшую спортсменку на полторы минуты. Успехи продолжаются на втором и третьем этапах: Кайса два раза финиширует на 2-м месте и два раза на 3-м, продолжая показывать хорошую стрельбу и быстрый ход.
Немецкие этапы складываются менее удачно, хоть Кайса и продолжает не покидать десятку, ее подводит то стрельба, то лыжный ход. На шестом этапе спортсменку встречают первые крупные неудачи. В спринте она финиширует 22-й с восьмым ходом, в масс-старте 27-й, допустив 6 промахов. После масс-старта результат Кайсы аннулировали: она нарушила пункт 5.6.е дисциплинарных правил IBU, не сдав лыжи на проверку после финиша. 6-й этап стоил Мякяряйнен сокращения преимущества в общем зачете с 42 очков до 14. Американские этапы прошли весьма успешно. Мякяряйнен вновь не покидала десятку сильнейших, подходя к Чемпионату мира в хорошей форме.
Первая же гонка на Чемпионате мира в Ханты-Мансийске принесла Кайсе первую медаль чемпионатов мира — серебро. В гонке преследования, отстрелявшись чисто, Мякяряйнен уверенно победила, став первой в истории чемпионкой мира по биатлону из Финляндии. Эти две медали стали последними: в индивидуальной гонке Мякяряйнен выступила неудачно, показав худший результат сезона, в масс-старте Кайса остановилась в шаге от медали. Уже после окончания чемпионата Кайса сообщила, что в гостинице, в которой она жила, была такая плохая кровать, что ей пришлось две недели спать на матрасе на полу.
Перед последним этапом Кубка мира, проходившим в норвежском Хольменколлене, Мякяряйнен была лидером общего зачёта с отрывом в 7 очков, а также лидером в программе двух малых кубков: спринта и преследования. Хотя неудачное выступление в спринте не позволило Мякяряйнен получить малый глобус спринтерских гонок, ограничившись только малым глобусом гонок преследования, по итогам сезона Мякяряйнен заработала 1005 очков, став первой обладательницей Кубка мира из Финляндии. За весь сезон Мякяряйнен не пропустила ни одной гонки, чем восхищались некоторые спортсменки. Свою победу в общем зачёте Мякяряйнен отпраздновала дискотекой с немецкими биатлонистками и танцами на столе. По итогам сезона спортсменка получила более ста тысяч евро призовых.
27 марта Кайса выступила в рождественской гонке звезд, где вместе с Кристофом Зуманом заняла пятое место.
За две недели перед стартом первого этапа, Мякяряйнен получила инфекцию, после которой потеряла голос, но болезнь не повлияла на результаты и в первых же гонках кубка мира Мякяряйнен показывает лучший ход в индивидуальной гонке, в спринте и уступает лишь Светлане Слепцовой в гонке преследования, однако ошибки на рубежах не позволяют Кайсе одержать победу, занимая четвертое, третье и второе место в гонках. В течение следующих трех этапов дела Кайсы складываются не столь радужно: за 6 личных гонок спортсменка допускает 21 промах и попадает на пьедестал лишь однажды, дважды попадая за пределы десятки. При этом, Кайса стабильно попадает в тройку самых быстрых спортсменок по итогам гонок, лишь однажды показывая девятый ход на дистанции. Несмотря на неудачную стрельбу на протяжении сезона, начало пятого этапа, совпавшее с днем рождения Мякяряйнен, приносит ей первую победу в индивидуальных гонках за всю карьеру. Остальные три этапа в Италии, Норвегии и Финляндии складываются вполне успешно: спортсменка трижды попадает на подиум, заканчивая последнюю гонку до чемпионата мира уверенной победой.
Чемпионат мира начинается с провала. 102-е место по скорости стрельбы и 4 промаха в спринте позволяют Кайсе занять лишь 27-е место. Стрельбы в гонке преследовании и в индивидуальной гонке также не складывается: 4 и 5 промахов вновь не позволяют спортсменке пересечь топ-20 — на чемпионате мира Кайса показывает худшие результаты сезона.
Неудачи на рубеже, продолжающиеся на протяжении всего чемпионата, преломляются в финальной гонке: первые три рубежа спорстменка отработала чисто. Промах на последней стрельбе позволил Кайсе бороться за победу с Турой Бергер и Мари-Лор Брюне, но на финише Мякяряйнен не хватило сил, и она финишировала третьей, впервые за три года поднявшись на пьедестал в гонке с общего старта.
Заключительный этап в России приносит спортсменке ещё 2 подиума. В целом сезон складывается очень успешно — Кайса набирает 1007 очков и поднимается на подиум 10 раз, вместо 1005 очков и 9 подиумов в прошлом сезоне.
В таблицу включены все гонки
В таблицу включены только личные гонки
На счету Мякяряйнен 24 призовых места на этапах Кубка мира:
Примечания:
«Na» — количество гонок, в которых спортсменка была заявлена, но не стартовала. Эти гонки не влияют на статистику;
«N*» — включена одна гонка, в которой спортсменка была дисквалифицирована после финиша. Такие гонки включены в общее число стартов.
В таблице отражены места, занятые спортсменом на гонках биатлонного сезона.
«*» — результат ожидается;
« • » — спортсмен не участвовал в этой гонке;
«—» — на данном этапе гонка не проводилась.