С 1800 г. экстраординарный, с 1811 г. ординарный профессор философии в Лейпциге. Приверженец, а позже — противник Канта. Его основные философские труды — книга «О Боге в природе, в истории человечества и в сознании» (нем. «Von Gott in der Natur, in der Menschengeschichte und im Bewu?tsein»; 1818—1822) и более ранние «Основы всеобщего учения о религии» (нем. «Grundri? der allgemeinen Religionslehre»; 1808), в которых Клодиус утверждает первоначально-религиозный характер человеческого сознания и все философские истины выводит из религиозного чувства. Клодиусу принадлежат, кроме того, «Набросок систематической поэтики» (нем. «Entwurf einer systematischen Poetik»; 1804), книга стихотворений, опубликованная посмертно аллегорическая поэма «Эрот и Психея», а также перевод на немецкий язык басен Лафонтена.