Родился на острове Анжуан. Работал в полиции, в 1980-х годах прошёл спецподготовку в качестве сотрудника президентской гвардии под руководством французских наёмников во главе с Бобом Денаром.
В сентябре 1995 года Денар организовал четвёртый военный переворот против правительства Коморских Островов, полковник Аюба был поставлен во главе государства на должности председателя Военного Комитета Коморских островов. Он находился на ней до 2 октября, когда французские войска разгромили сторонников Денара и Ауюбы во время проведения операции Azalee.
Был застрелен в своем доме в Морони 13 июня 2010 года. После этого ряд высокопоставленных государственных и военных лидеров Коморских островов получали письма с угрозами убийства в течение нескольких месяцев после гибели Аюбы.