Атлантиды моря Тетис. — Л.: Гидрометеоиздат, 1986. — 168 с.
Атлантиды пяти океанов. — Л.: Гидрометеоиздат, 1987; 1988. — 160 с. 2-я книга трилогии.
Атлантиды ищите на шельфе. — Л.: Гидрометеоиздат, 1988. — 224 с. На 4 с. обл.: "...десятая книга А.М.Кондратова, выходящая в Гидрометеоиздате, и юбилейная, пятидесятая книга, выходящая в год его пятидесятилетия".
Другие затонувшие земли
Атлантика без Атлантиды. — Л.: Гидрометеоиздат, 1972. — 160 с. 8 л. ил.
Адрес — Лемурия? — Л.: Гидрометеоиздат, 1978. — 136 с. 4 л. ил.
Была земля Берингия. — Магадан, 1981. — 200 с.
Была земля Арктида. — Магадан, 1983. — 200 с.
Древние цивилизации
Великаны острова Пасхи. — М.: Советский художник, 1966. — 186 с. (Страницы истории искусств).
Погибшие цивилизации. — М.: Мысль, 1968. — 312 с. ил.
А.М.Кондратов, В.В.Шеворошкин. Когда молчат письмена. Загадки древней Эгеиды. — М.: Наука, 1970. — 228 с.
Этруски — загадка номер один. — М.: Знание, 1977. — 94 с.
Великий потоп. Мифы и реальность. — Л.: Гидрометеоиздат, 1982; 1984. — 152 с.
Индийские йоги.Кто они? - А.Кондратов
Палеонтология
Динозавра ищите в глубинах. — Л.: Гидрометеоиздат, 1984; 1985. — 144 с.
Шанс для динозавра. — СПб.: Гидрометеоиздат, 1992. — 288 с. (3-е изд. перер. и доп.)
Океанология
Тайны трех океанов. — Л.: Гидрометеоиздат, 1971. — 248 с.
Загадки Великого океана. — Л.: Гидрометеоиздат, 1974. — 224 с.
Следы на шельфе. — Л.: Гидрометеоиздат, 1981. — 152 с.
Математика
Математика и поэзия. — М.: Знание, 1962. — 48 с.
Число и мысль. — М.: Детгиз, 1963. — 142 с.
Электронный разум. — М.: Знание, 1987. — 176 с.
Лингвистика
Звуки и знаки. — М.: Знание, 1966; 1978. — 207 с.
Земля людей — земля языков. — М.: Детская литература, 1974. — 192 с.
Книга о букве. — М.: Советская Россия, 1975. — 224 с.
Формулы чуда. - М.: Детская литература, 1987. - 143 с.
Стихотворения
Стихи тех лет / Сост. В.И. Уфлянда. — СПб.: "Издательство Буковского", 2001. — 72 с. — Тир. 500 экз.
Александр Третий. — СПб.: Геликон Плюс, 2002. — 104 с. — (СТИМКККОН).