Родился в Симферополе 18 июля 1958 года. В 1975 после окончания школы с золотой медалью поступил в Крымский мединститут, который с отличием закончил в 1981 году. После окончания аспирантуры в 1986 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Устойчивость конформации иммуноглобулинов G в норме и при хроническом лимфолейкозе» (научный руководитель — член-корреспондент Академии наук Украины, заслуженный деятель науки Украины, профессор Г. В. Троицкий). В 1986 году стал одним из основателей гибридомной лаборатории в КГМУ. С 1986 года работал старшим, ведущим, а затем главным научным сотрудником КГМУ; с 1992 года — заведующий лабораторией биотехнологии. В 1994 году защитил докторскую диссертацию на тему «Исследование иммуноглобулинов в норме и при патологии с помощью моноклональных антител и спектральных методов» (научный консультант — Г. В. Троицкий), в которой использовал пептиды насекомых для исследования белков человека. С 1995 г. — профессор, с 1999 г. — заведующий кафедрой биохимии Крымского государственного медицинского университета.
Главными областями научных интересов К. А. Ефетова являются молекулярная иммунология, эволюционная биология и биосистематика. С помощью спектральных методов он доказал существование изменения конформации иммуноглобулинов человека при злокачественных новообразованиях. Впервые предложил использовать белки и пептиды насекомых в качестве молекул-зондов для исследования белков человека в норме и при патологии. Основал новое научное направление — моноклональную иммуносистематику, которая позволяет оценивать эволюционные взаимоотношения между биологическими видами на основе изучения их белков с помощью моноклональных антител.
К. А. Ефетовым описано 4 новых рода и 10 подродов живых организмов, открыто 26 биологических видов, обитающих в Японии, Корее, Индонезии, Китае, Тайване, Вьетнаме, Мьянме (Бирме), Новой Зеландии, Индии, России, Кыргызстане, Туркменистане, Афганистане, Украине, Венгрии. Результаты его исследований были неоднократно представлены на международных конгрессах и симпозиумах, проводившихся в разных странах Европы. В 2004 г. на базе Крымского государственного медицинского университета им был организован и проведен международный симпозиум «Биология, филогения, молекулярная биология и генетика Zygaenidae».
К. А. Ефетов — автор (соавтор) более чем 360 научных публикаций, включая более 30 монографий и 12 патентов на изобретения. 132 его научные работы процитированы 572 раза в публикациях ученых из 23 стран мира на 9 языках (в том числе английском, венгерском, испанском, итальянском, немецком, французском, японском). Подготовил 1 доктора и 2 кандидатов наук, в настоящее время (2009 г.) под его руководством выполняются 1 докторская и 5 кандидатских диссертаций.
К. А. Ефетов является академиком Крымской академии наук (с 2002), заслуженным деятелем науки и техники Украины (с 2004), председателем Крымского биохимического общества (c 2006), членом Центрального совета Украинского биохимического общества (с 2006), вице-президентом Малой академии наук Крыма (с 1997), членом Союза русских, украинских и белорусских писателей Автономной Республики Крым (с 2008). С 1992 года является членом Европейского лепидоптерологического общества (в 2005—2009 входил в состав его Совета).
За свои достижения в области биологии и медицины К. А. Ефетов награждён четырьмя золотыми медалями: «Тысяча великих учёных» (Великобритания, 2002), «Выдающиеся европейцы XXI века» (Великобритания, 2003), «Международный учёный года» (Великобритания, 2003), «Медаль почёта» (США, 2004). Он включён в биографические справочники «Кто есть кто в современности» (США) и «Выдающиеся европейцы XXI века» (Великобритания). В честь К. А. Ефетова учёными из Австрии, Франции, Украины и России названы 3 биологических вида (Etroga efetovi Richter, 1994; Zygaenoprocris efetovi Mollet et Tarmann, 2007; Chrysartona efetovi Parshkova, 2007) и подрод живых организмов (Efetovia Mollet, 2001).
К. А. Ефетов также является лауреатом Государственной премии Автономной Республики Крым (1996), лауреатом Премии Совета министров Автономной Республики Крым (2000), лауреатом Премии Автономной Республики Крым (2008); награждён Почётными грамотами Президиума Верховной Рады Автономной Республики Крым (1998), Совета министров Автономной Республики Крым (1998, 2002), Министерства здравоохранения Украины (1998).
К. А. Ефетов входит в состав редакционных коллегий научных журналов «Таврический медико-биологический вестник» (Украина) и «Entomologist’s Gazette» (Великобритания), а также научного сборника «Проблемы, достижения и перспективы развития медико-биологических наук и практического здравоохранения (Труды Крымского государственного медицинского университета им. С. И. Георгиевского)»; является членом редакционного совета научного сборника «Вестник морского врача».
В 2006—2008 годах К. А. Ефетов опубликовал несколько книг («Шокирующая тайна Сикстинской капеллы» и «Ветхозаветная тайна ребра Адама») и статей (в журналах «Химия и жизнь», «Асклепий», «Открытия и гипотезы»), посвящённых его необычным гипотезам на стыке медицины, искусства и истории. В частности, автор утверждает, что на фресках Микеланджело в Сикстинской капелле имеется несколько «невидимых» изображений, которые, будучи рассмотренными, кардинально меняют представления зрителя о том, что именно хотел сказать своими фресками их создатель. Другая гипотеза посвящена интерпретации библейского мифа о сотворении женщины из ребра Адама: автор усматривает параллели между деталями этого мифа и биохимическим механизмом образования женских половых гормонов. Эти гипотезы получили широкий отклик в Интернете и даже были использованы в вопросах мирового чемпионата «Что? Где? Когда?».
К. А. Ефетов является автором нескольких поэтических сборников: «Взмах крыльев», «Чёрно-белый квадрат», «Жизнь „летучих мышей“», «Колодцы памяти», «Шеф говорил…», «Слова отцов», «Мудрость Востока», «Вечные истины», «Афористишия», «Афоризмы и пословицы крымских караимов в стихах», «Вечность или миг?», «Прислушиваясь к великим», «Итальянские афористишия» и «Кто такой этот Шерлок Холмс?». Он также является автором текста гимна, автором флага и соавтором герба Крымского государственного медицинского университета.