Кроме любовных стихотворений, первым произведением его была хроника в 3-х книгах; позднейшие его труды написаны под влиянием Варрона, с предпочтением к истории культуры и к морализующим биографиям.
Сюда относятся пять книг «Exempla», подробные жизнеописания Катона Старшего и Цицерона и в особенности его последний и наиболее обширный труд: «De viris illustribus» — около 16 книг, с параллельными биографиями римлян и иноплеменников. Сохранились ещё отрывки из книг «De latinis historicis» и «De excellentibus ducibus exterarum gentium».
Благодаря простому и правильному стилю, произведения Корнелия традиционно использовались при обучении латыни наряду с «Записками о Галльской войне» Юлия Цезаря. Непот входил в число «школьных авторов» в России XIX века, и его книга неоднократно переиздавалась в оригинале с примечаниями.
Непоту приписывается известное выражение: «Si vis pacem, para bellum».
Издавали К. H. Halm (Лпц., 1871), Cobet (Лейден, 1891), Gitlbauer (Фрейберг, 1883), Weidner (Прага, 1888).
В 1705 году И. Г. Паузе сделал русский рукописный перевод сборника жизнеописаний Корнелия Непота, издано же сочинение на русском языке было впервые в 1748 году в переводе В. Лебедева.
Русские переводы: