Кристиан учился в веймарской гимназии, затем был зачислен на юридический факультет Йенского университета, впоследствии перевёлся в Эрланген. К этому периоду относятся первые публикации Вульпиуса, в которых советом принимал участие и Гёте.
По протекции Гёте осенью 1789 года лейпцигский книготорговец Георг Иоахим Гёшен нанял Вульпиуса в качестве своего секретаря. Затем Вульпиус служил в веймарском театре в качестве либреттиста и редактора. В 1797 году он получил постоянную ставку регистратора в веймарской библиотеке, и в этом ему, как предполагается, также помог Гёте. В 1800 году Вульпиус получил повышение и стал секретарём библиотеки.
В 1801 году Кристиан Вульпиус женился на Хелене Деане. У них родилось двое сыновей. В 1803 году Йенский университет присвоил Вульпиусу звание доктора филологии. Двумя годами позже Вульпиус получил должность штатного библиотекаря и инспектора монетного двора. В 1816 году Вульпиус получил титул советника великого герцога. В том же году был избран рыцарем ордена белого сокола.
В 1824 году с Вульпиусом случился удар, ограничивший его возможности в работе, и он ушёл на пенсию. После второго удара в феврале 1827 года он не смог уже оправиться и умер 26 июня 1827 года в Веймаре.
Известность Вульпиуса как писателя ограничена его многократно переиздававшимся разбойничьим романом «Ринальдо Ринальдини, атаман разбойников», которым автор точно угодил вкусам публики. Вульпиус написал несколько романов-продолжений. В первой экранизации романа «Ринальдо Ринальдини» 1927 года заглавную роль сыграл Ганс Альберс. В 1968 в ФРГ по роману снят телевизионный сериал.