Кристиан Лелль начал карьеру в молодёжном клубе «Алеманния», затем перешёл в «Баварию». В сезоне 2001/2002 впервые начал выступать во второй команде «Баварии», сыграв 10 матчей в региональной лиге. Лишь в сезоне 2003—2004 Лелль смог выйти в первой команде «Баварии», сыграв за сезон 4 игры. В 2004 году Лелль на правах аренды за 25 400 евро перешёл в клуб «Кёльн», выступавший во второй бундеслиге. В первый сезон Лель сыграл за команду 16 игр, 7 раз выходя на замену, а ближе к концу сезона главный тренер «Кёльна» Хууб Стивенс отправил его во вторую команду клуба, где он сыграл 8 матчей в региональной лиге. Но уже в следующем сезоне Лелль стал игркоом основы Кёльна.
В сезоне 2006/2007 Лелль вернулся в «Баварию», а зимой продлил контракт с командой до 2009 года. В сезоне 2007/2008, благодаря травме Вилли Саньоля, Лелль смог завоевать твёрдое место в основе «Баварии», а в 27-м туре забил свой первый гол за клуб, поразив ворота «Бохума».
В январе 2010 года мог перейти в «Нюрнберг», однако не согласовал вопросы по поводу своей зарплаты.
В июне 2010 года перешел в берлинскую «Герту». Контракт был заключён сроком на один сезон с возможностью продления на ещё два.
Лелль выступал за молодёжные сборные Германии разных возрастов, начиная с команды 16-ти летних, в которой он дебютировал в матче с Турцией. В 2003 году Ллель участвовал в молодёжном чемпионате мира U-20.
В 2010 году Кристиан выразил желание выступать за сборную Австрии, однако федерация футбола Австрии отказала ему, так как на момент дебюта в молодёжной сборной Германии у него ещё не было австрийского паспорта.
В ночь с 24 на 25 февраля 2007 года Лелль был арестован полицией из-за скандала, с применением физической силы, со своей подругой, но после допроса был отпущен. 16 ноября 2007 года Лелль вновь был арестован, после того, как вновь применил физическое воздействие на тело подруги, полиция подтвердила увечья девушки, но ход дела был вновь приостановлен.
Сестра Кристиана, Мари-Тереза Лелль, больна муковисцидозом, в 2009 году Лелль основал институт по борьбе с этой болезнью, внеся стартовый капитал 100 тыс. евро.