При правлении Кристофера произошло резкое падение влияния королевской власти в результате действия городов Ганзейского союза и усиления политической власти датских и шведских государственных советов.
Вероятно, родился в Ноймаркте (Верхний Пфальц). Сын пфальцграфа Иоганна Пфальц-Ноймарктского и Катерины Вратиславовны, сестры Эрика Померанского. Пфальцграф Иоганн был сыном германского короля Рупрехта Пфальцского.
В 1445 году женился на Доротее Бранденбургской (1430 — 25 ноября 1495).
Происходил по матери из датского королевского рода и являлся ближайшим наследником короны в виду бездетности короля Эрика Померанского. После смещения с престола Эрика Померанского Кристофер был выбран датской знатью в качестве преемника своего дяди. В 1438 году Кристофер получил от датского государственного совета, воспользовавшегося временным отсутствием из Дании нелюбимого высшей аристократией Эрика, приглашение немедленно явиться в Данию, если хочет, чтобы королевская власть сохранилась за его родом. Кристофер прибыл туда следующим летом. Государственный совет объявил Эрика низложенным, в Кристофер был назначен регентом в 1439 году, затем коронован в 1440 году. Позже он был признан также королём Швеции и Норвегии.
Возможно, его рассматривали как марионетку в делах датского дворянства, однако он смог проводить свою независимую политику. В общем, его правление можно считать началом долгого периода баланса между королевской властью и дворянством, продолжавшегося до 1660 года.
В 1441 году Кристофер подавил большое крестьянское восстание в северной Ютландии — одно из центральных событий его короткого правления. В целом его господство означало растущее давление на крестьянство, особенно в восточной Дании. С другой стороны он старался поддержать города и купцов, насколько это позволяли условия, поставленные городами Ганзейского союза.
Во время правления Кристофера Копенгаген стал постоянной столицей Дании (хартия 1443 года). Кальмарская уния стала чисто внешней, «личной унией»; ганзейские города добились отмены установленной Эриком пошлины за проход судов через пролив Зунд; высшей аристократии было обещано, что она вновь станет диктовать королю условия; Адольфу Шаумбургскому была отдана в наследственное владение южная Ютландия вместе с Хадерслевом и островом Эрё. Народной любви Кристофер не заслужил; только высшее духовенство к нему очень благоволило за увеличение доходов, собираемых с народа.
Проводил нерешительную политику войны и переговоров против своего дяди, обосновавшегося на острове Готланд. Результаты этой политики так и не были достигнуты. В 1448 году бездетный Кристофер внезапно скончался в Хельсингборге (сейчас принадлежит Швеции). Он был последним потомком Вальдемара IV Аттердага. Следующий правитель Кристиан I положил начало правлению новой династии Ольденбургов. 28 октября 1449 года вдовствующая королева Доротея вступала в брак с новым королём Кристианом I.
Похоронен в соборе города Роскилле. В 1654 году род Виттельсбахов, к которым принадлежал Кристофер, вернулся к власти в Швеции.