Князь был родом из биржайской ветви Радзивиллов. Родители — Николай «Рыжий» Радзивилл и Катажина Томиская. Брат — Миколай Радзивилл, ловчий литовский.
Супруги Катажина Собек, Екатерина (Катажина) Острожская (1560—1579), Катажина Тенчыньская (в литературе также транслитерируют как Катаржина Течиньская), Елизавета Острожская.
Дети с Екатериной Острожской — Януш Радзивилл (1579—1620), с Катажиной Тенчыньской — Христофор Радзивилл (младший) и Халашка Радзивилл.
В 1564 году, будучи семнадцатилетним, Кшиштоф вместе с отцом принял участие в Ливонской войне. Он показал себя сообразительным молодым воином и заслужил прозвище «Перун».
В 1577 году Иван Грозный вновь вторгнулся в Ливонию и разорил её, начав последний этап войны, продолжавшийся пять лет. Польный гетман Радзивилл отличился в сражении при Великих Луках и возглавил осаду города. Участвовал в походе Стефана Батория на Псков и вместе с 4000 всадников совершил конный рейд в центральные районы России, чтобы русские не смогли собрать силы для снятия осады Пскова. С 5 августа по 22 сентября 1579 года его войска прошли 1400 км через Витебск, Ржев, Старицу, в которой останавливался сам царь Иван IV, Торопец и Старую Руссу у озера Ильмень, неоднократно вступая в сражение с русскими войсками. В 1583 году Ливония вошла в состав Речи Посполитой в качестве совместно управляемой Польшей и Литвой территории, её правителем был назначен епископ виленский Юрий Радзивилл.
В 1601 году отразил наступление шведской армии под Кокенгаузеном (ныне — Кокнесе, Латвия), на правом берегу Даугавы, и освободил крепость Венден (ныне Цесис).
Кшиштоф Миколай Радзивилл был одним из самых талантливых военачальников Речи Посполитой времён войн с Россией и Швецией. Он был участником всех войн при Стефане Батории. Собственные его достижения наряду с поддержкой клана Радзивиллов помогли Кшиштофу достичь высоких постов в государстве и увеличить состояние своей семьи.
Он был сторонником короля Стефана Батория и близким сподвижником канцлера Яна Замойского. В царствование Сигизмунда III перешёл в оппозицию, но заботился о сохранении нормальных отношений с монархом.
Подобно отцу, брату и племяннику, он был ярым кальвинистом и сторонником польской протестантской церкви, отстаивал позиции протестантов во время контрреформации.
Чтобы защитить северные границы Литвы и свои владения, Кшиштоф Радзивилл построил Биржайский замок. До 1575 года были перегорожены реки Апащя и Аглуона, и болото карстового происхождения Ширвенос превратилось в первый искусственный водоём в Литве, площадью 400 гектаров. Строительство бастионов крепости итальянского типа началось в 1586 году, а завершилось в 1589 году. Биржай стал важным опорным пунктом Великого княжества Литовского и фамильной резиденцией Радзивиллов. 1 мая 1589 года городу Биржаю было предоставлено магдебургское право.
Продолжил начатую отцом политику распространения евангелической протестантской церкви в Великом княжестве Литовском. Построил в 1584 году две евангелические церкви в Биржае и в местечке Нямунелио-Радвилишкис, а в 1595 году — усадьбу Радзивиллов в Папилисе. Помогал биржайской гимназии и школе в Кедайняе. Король Сигизмунд III, несмотря на неприязнь к протестантам, был вынужден считаться с военными способностями гетмана.
Радзивилл похоронен в мавзолее Кедайняйской евангелической реформатской церкви.