Кутб ад-Дин Мухаммед воспитывался в Мерве. В 1097 году, незадолго после убийства предыдущего правителя шаха Экинчи, он был назначен правителем Хорезма и принял древний титул хорезмшаха. В течение всего своего правленя оставался вассалом сельджукского султана Санджара, сохраняя лояльность к нему. В 1113 или 1114 году участвовал в подавлении волнений в государстве Караханидов, вассальном Сельджукидам. В 1119 принимал участие в военной компании султана Санджара против султана Гийас ад-Дина Мухаммада, правившего в Западном Иране и Ираке.
В 1127 году Кутб ад-Дин Мухаммед умер, и на престоле Хорезма его сменил его сын Ала ад-Дин Атсыз.