Сын консула 98 до н. э. Квинта Цецилия Метелла Непота, брат Квинта Цецилия Метелла Целера, консула 60 до н. э..
Будучи народным трибуном, воспрепятствовал произнесению Цицероном речи в последние дни своего консульства, что Цицерон, недавно получивший титул отца отечества (pater patriae) за разоблачение Катилины, счёл оскорблением. Более того, он вместе с некоторыми другими политиками даже хотел судить Цицерона за незаконную казнь римских граждан (однако ему не удалось воплотить эту инициативу в жизнь).
После избрания консулом на 57 до н. э., поддерживал народного трибуна Клодия и содействовал изгнанию Цицерона из Рима. В то же время, когда Клодий чрезмерно усилился и стал угрожать спокойствию в Риме, присоединился к людям, призывавшим Цицерона вернуться в Рим.
В 56 до н. э. стал проконсулом Ближней Испании.
Цицерон упоминает Непота в числе второстепенных ораторов, отмечая его способности и образование, но добавляя, что он произносил не судебные, а политические речи.