В возрасте 16 лет окончил колледж Пармского музея античности (см. Parma Archaeological Museum). Под руководством Пеллегрино Штробеля и Гаэтано Кьеричи начал участвовать в археологических раскопках на территории Пармезана. В 1863 путешествовал по Швейцарии и Тоскане, учился в Риме и Неаполе.
В Парме преподавал курс древней истории, где пытался объяснить использование и назначение различных доисторических орудий. Через несколько лет после получения степени бакалавра искусств стал директором Пармского музея античности.
Одним из первых применил в истории комплексный подход. Работа Пигорини совместно с Штробелем, посвящённая озёрным поселениям Террамарской культуры, объединяла данные палеонтологии, ботаники, зоологии, энтомологии, палинологии, геологии, антропологии и археологии для составления полной картины жизни людей в бронзовом веке.
В 1875 г. совместно с Кьеричи и Штробелем основал палеэтнологический журнал Bullettino di Paletnologia Italiana. В том же году начал работать в управлении Генерального директора музеев и раскопок Италии. Ходатайствовал перед министром публичного образования Италии, Бонги, об основании историко-этнографического музея в Риме. Музей, который впоследствии получил название Музей Пигорини, был открыт в 1876 году. За выдающиеся заслуги перед итальянской исторической наукой в 1912 г. назначен пожизненным сенатором. С 1919 г. и до смерти — вице-президент итальянского сената.