Иностранный почётный член Российской академии наук с 11 сентября 1780.
Занимался медицинской практикой в Вене и в 1754—1759 совершил по поручению императора Франца I большое путешествие по Америке (особенно Вест-Индии), чтобы приобрести новые растения для императорских садов.
Вернувшись, стал профессором химии и ботаники сначала в Банска-Штьявница, а затем в Вене, где был также директором Академического, а позже Шёнбруннского садов.
В 1806 получил баронское достоинство.
Главные труды
- «Flora austriaca», 1773—1778, 5 томов, с 450 раскрашенными таблицами;
- «Enumeratio stirpium», 1762
- «Selectarum stirpium americanarum historia», 1763 и 1780, с 264 таблицами;
- «Observationes botanicae», 1764, 4 тома, со 100 таблицами;
- «Hortus botanicus Vindobonensis», 1770—1776, 3 тома, с 300 таблицами;
- «Icones plantarum rariorum», 1781—1793, 3 тома, с 648 таблицами;
- «Collectanea ad botanicam, chemiam et historiam naturalem spectantia» 1786—1796, 5 томов, со 106 таблицами;
- «Plantarum rariorum horti caesarei Schoenbrunnensis descriptiones et icones», 1797—1804, 4 тома, с 500 таблицами;
- «Stapeliarum in hortis Vindobonensibus cultarum descriptiones», 1806, с 64 таблицами.
Названы в честь Жакена
Линней назвал в честь Жакена род Jacquinia из семейства Мирзиновые.