Доктор технических наук, член-корреспондент АН СССР (1976). Главный инженер проекта Куйбышевской ГЭС института «Гидропроект».
Родился 6 декабря (23 ноября по старому стилю) 1911 года, в селе Крапивино Нижегородской губернии.
Окончил Ленинградский индустриальный институт в 1934 году. Член КПСС с 1942 года.
В 1935?1941 годах работал на Волгострое, в 1941?1942 ? в Управлении оборонительных работ, в 1942?1943 ? на строительстве Широковской ГЭС.
С 1944 по 1947 годы руководил разработкой ряда проектов гидротехнических сооружений (в том числе при восстановлении Беломорско-Балтийского канала, на строительстве Куйбышевской ГЭС, Асуанской плотины). С 1947 года — заместитель начальника «Гидропроекта».
Основные труды Малышева посвящены разработке проектов уникальных комплексных гидроузлов (в том числе на реках Волга, Нил, Евфрат). Предложил и практически доказал возможность строительства высотных плотин и мощных ГЭС на любых естественных основаниях.
Умер 13 марта 2005 года в Москве. Похоронен на Троекуровском кладбище.