Окончил авиационный институт в Уфе. С 1955 по 1977 — опытно-конструкторская и изобретательская деятельность в НИИ ракетной техники. Был начальником КБ, главным конструктором информационных моделей космических летательных аппаратов и средств управления ими. В 1965—1977 участвовал в осуществлении полетов КЛА. Докторская диссертация посвящена теме «Философия информационной цивилизации» (1996). С 1995 — профессор Дипломатической академии МИД РФ.
С 1970 г. начал системные исследования философских проблем НТР, а к концу 1980-х обосновал новую философскую концепцию «информационной цивилизации». Создал и с 1988 г. читает в вузах новый курс философии. В 1993 г. избран Президентом Отделения философии информационной цивилизации Международной Академии информатизации. Академик МАИ. Получил 24 авторских свидетельства на изобретения.
Абдеевым предпринята попытка осуществить синтез информатики, кибернетики и синергетики с классической теорией развития и выявить генезис феномена управления. Им выдвинута и обоснована концепция спирали развития, нелинейная («сходящаяся») по форме и создаваемая построением в координатах энтропии-информации; разработана естественно-научная — информационная — картина мира. В центре внимания исследований Абдеева — проблемы устойчивого развития социума в процессе коэволюции человечества и биосферы, участие в создании гуманной общепланетарной философии XXI в.