Получил военное образование в Великобритании и США. В 1983 и 1985 годах участвовал в подготовке военных переворотов. С 1990 года — министр обороны, с 1992 года — вице-президент Нигерии. С 1993 года после организованного им переворота стал председателем Временного правящего совета и Федерального исполнительного совета.
Период правления Абачи был отмечен серией внешнеполитических неудач. Из-за многочисленных нарушений прав человека США ввели против Нигерии экономические санкции, её членство в Содружестве наций было приостановлено.
В настоящее время правительство Нигерии пытается вернуть в страну поступления от экспорта нефти, вывезенные Абачей за рубеж, и составляющие по оценочным данным сумму в 4 млрд долл. Поиском похищенных средств в банках Швейцарии и Люксембурга занимается итальянский юрист Энрике Монфини, специалист по делам такого рода.
В июне 2010 года младший сын диктатора, Абба Абача (1968 г. рожд.) был условно осуждён швейцарским судом в г. Женеве на 24 месяца тюремного заключения за «отмывание денег» в период правления своего отца. Абба, вместе со своим старшим братом Мохаммедом, контролировал значительную часть денег своего отца после открытия секретных счетов в швейцарских банках. Часть этих денег (около 600 миллионов долларов) Швейцария возвратила Нигерии по просьбе этой страны.