Совершил путешествие в Китай. Во время научной экспедиции Наполеона Бонапарта в Египет в 1798—1802 годах, Савиньи сопровождал, в качестве зоолога, Жофруа Сент-Илера. В экспедиции он занимался, главным образом, изучением беспозвоночных. По возвращении, Савиньи публикует между 1809 и 1813 годом около пятидесяти исследовательских публикаций о насекомых, на основе материалов, собранных в этой кампании.
30 июля 1821 года Савиньи был избран членом Французской академии. Он состоял также членом многочисленных иностранных академий, в частности, Прусской Королевской академии наук.
В 1824 году он лишился зрения.
В честь учёного был назван род растений Savignya семейства Капустные (Brassicaceae).
Труды Савиньи посвящены орнитологии, им описаны птицы Египта и Сирии. Также он дал описание беспозвоночных, обитающих в Египте и Сирии, а именно паукообразных, ракообразных, моллюсков, червей и других, анатомию сложных асцидий. Главная заслуга Савиньи — установление гомологии ротовых частей насекомых.