Всю свою жизнь он боролся за независимость Индии, отстаивал также национальные интересы Пакистана.
В 1885 году стал 48 имамом исмаилитов.
1902—1904 — член Совета при вице-короле Индии.
В 1906 году стал одним из основателей и первым президентом Индийской Мусульманской лиги, которая позже сыграла важную роль в создании независимого государства Пакистан.
В 1913 году вышел из состава лиги.
В годы Первой мировой войны оказал значительную помощь Великобритании и её союзникам.
1930—1932 — возглавлял индийскую делегацию на конференции «Круглого стола» в Лондоне
1932, 1934—1937 возглавлял делегацию Индии в Лиге Наций.
С 1934 года — член Тайного совета Великобритании.
1937—1938 — был председателем Лиги Наций.
У них двое сыновей:
Тереза приняляа ислам, именовалась принцессой Ага-хан. Умерла после операции, проведённой 1 декабря 1926 года.
У них сын — Принц Садруддин Ага-хан.
Свои политические взгляды Ага-хан III изложил в книге «Индия в переходный период» (англ. India in Transition, 1918), где в ряде аспектов предвосхитил концепцию британского Содружества наций.
Решил выбрать преемником не одного из двух своих сыновей, а внука — принца Карима. Принц Али Соломон Хан, его старший сын и отец принца Карима, был известен в международных кругах своим разгульным образом жизни, а также женитьбой на американской актрисе Рите Хейворт. Принц Али был представителем Пакистана в ООН с 1958 по 1960 год. Ага-хан назначил принца Карима своим преемником ещё при жизни принца Али.
Ага-хан III скончался 11 июля 1957 года в своём доме в Версуа (Швейцария). В 1959 году захоронен в Мавзолее Ага-хана в Асуане (Египет).
Мавзолей построен в стиле гробницы Фатимидов в Каире. В мавзолее с перекрытым куполом внутренним помещением и открытой лестницей из асуанского гранита установлен белый, украшенный изречениями из Корана мраморный саркофаг. У изголовья — изящная вазочка с единственной розой. Розу меняют каждое утро.